Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04248
• Subject: XM_011545290.1
• Aligned Length: 1791
• Identities: 1380
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGAGCCGCCGCTCTACCCGATGGCGGGGGCTGCGGGGCCGCAGGGCGACGAGGACCTGCTCGGGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCGGACGGGCCCGAGGCCCCGCTGGACGAGCTGGTGGGCGCGTACCCCAACTACAACGAGGAGGAGGAGGAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCCGCTACTACCGCCGCAAGCGCCTGGGCGTGCTCAAGAACGTGCTGGCTGCCAGCGCCGGGGGCATGCTCACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACGGCGTCTACCTGGGCCTCCTGCAGATGCAGCTGATCCTGCACTACGACGAGACCTACCGCGAGGTGAAGTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGGCAACATGGGGCTGCCCGACATCGACAGCAAAATGCTGATGGGCATCAACGTGACTCCCATCGCCGCCCTGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCTACACACCTGTGCTCATCAGGTTTTTTGGAACGAAGTGGATGATGTTCCTCGCTGTGGGCATCTACGCCCTC  444
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGATGTTCCTCGCTGTGGGCATCTACGCCCTC  33

Query  445  TTTGTCTCCACCAACTACTGGGAGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGGCATGGCCATCGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   34  TTTGTCTCCACCAACTACTGGGAGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGGCATGGCCATCGT  107

Query  519  GCCTCTTTGGGCTTCCATGGGCAACTACATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACTACAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  GCCTCTTTGGGCTTCCATGGGCAACTACATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACTACAAGG  181

Query  593  AGCAGGATGGGCAGGGGATGAAGCAGCGGCCTCCGCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  AGCAGGATGGGCAGGGGATGAAGCAGCGGCCTCCGCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCC  255

Query  667  ATCTTCTACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCCAGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  ATCTTCTACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCCAGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCT  329

Query  741  GTATGACCTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACCAACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  GTATGACCTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACCAACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCA  403

Query  815  ACAAGACGGTTCTGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGAGAGCGTGCTCATGGCAGTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  ACAAGACGGTTCTGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGAGAGCGTGCTCATGGCAGTGGCC  477

Query  889  TTCCTGGCCATGCTGCTGGTGCTGGGTTTGTGCGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAGGAGATCGATCTGCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  TTCCTGGCCATGCTGCTGGTGCTGGGTTTGTGCGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAGGAGATCGATCTGCGCAG  551

Query  963  CGTGGGCTGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAGCACGTGCGTGACTACCGCCTGCGCCACCTCGTGCCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  CGTGGGCTGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAGCACGTGCGTGACTACCGCCTGCGCCACCTCGTGCCTT  625

Query 1037  TCTTTATCTACAGCGGCTTCGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTATCGCCTTGGGCTATGGCGTGTGCTCGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  TCTTTATCTACAGCGGCTTCGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTATCGCCTTGGGCTATGGCGTGTGCTCGGTG  699

Query 1111  GGGCTGGAGCGGCTGGCTTACCTCCTCGTGGCTTACAGCCTGGGCGCCTCAGCCGCCTCACTCCTGGGCCTGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  GGGCTGGAGCGGCTGGCTTACCTCCTCGTGGCTTACAGCCTGGGCGCCTCAGCCGCCTCACTCCTGGGCCTGCT  773

Query 1185  GGGCCTGTGGCTGCCACGCCCGGTGCCCCTGGTGGCCGGAGCAGGGGTGCACCTGCTGCTCACCTTCATCCTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  GGGCCTGTGGCTGCCACGCCCGGTGCCCCTGGTGGCCGGAGCAGGGGTGCACCTGCTGCTCACCTTCATCCTCT  847

Query 1259  TTTTCTGGGCCCCTGTGCCTCGGGTCCTGCAACACAGCTGGATCCTCTATGTGGCAGCTGCCCTTTGGGGTGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  TTTTCTGGGCCCCTGTGCCTCGGGTCCTGCAACACAGCTGGATCCTCTATGTGGCAGCTGCCCTTTGGGGTGTG  921

Query 1333  GGCAGTGCCCTGAACAAGACTGGACTCAGCACACTCCTGGGAATCTTGTACGAAGACAAGGAGAGACAGGACTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  GGCAGTGCCCTGAACAAGACTGGACTCAGCACACTCCTGGGAATCTTGTACGAAGACAAGGAGAGACAGGACTT  995

Query 1407  CATCTTCACCATCTACCACTGGTGGCAGGCTGTGGCCATCTTCACCGTGTACCTGGGCTCGAGCCTGCACATGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  CATCTTCACCATCTACCACTGGTGGCAGGCTGTGGCCATCTTCACCGTGTACCTGGGCTCGAGCCTGCACATGA  1069

Query 1481  AGGCTAAGCTGGCGGTGCTGCTGGTGACGCTGGTGGCGGCCGCGGTCTCCTACCTGCGGATGGAGCAGAAGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  AGGCTAAGCTGGCGGTGCTGCTGGTGACGCTGGTGGCGGCCGCGGTCTCCTACCTGCGGATGGAGCAGAAGCTG  1143

Query 1555  CGCCGGGGCGTGGCCCCGCGCCAGCCCCGCATCCCGCGGCCCCAGCACAAGGTGCGCGGTTACCGCTACTTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  CGCCGGGGCGTGGCCCCGCGCCAGCCCCGCATCCCGCGGCCCCAGCACAAGGTGCGCGGTTACCGCTACTTGGA  1217

Query 1629  GGAGGACAACTCGGACGAGAGCGACGCGGAGGGCGAGCATGGGGACGGCGCGGAGGAGGAGGCGCCGCCCGCAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218  GGAGGACAACTCGGACGAGAGCGACGCGGAGGGCGAGCATGGGGACGGCGCGGAGGAGGAGGCGCCGCCCGCAG  1291

Query 1703  GGCCCAGGCCTGGCCCCGAGCCCGCTGGACTCGGCCGCCGGCCCTGCCCGTACGAACAGGCGCAGGGGGGAGAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292  GGCCCAGGCCTGGCCCCGAGCCCGCTGGACTCGGCCGCCGGCCCTGCCCGTACGAACAGGCGCAGGGGGGAGAC  1365

Query 1777  GGGCCGGAGGAGCAG  1791
            |||||||||||||||
Sbjct 1366  GGGCCGGAGGAGCAG  1380