Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04287
• Subject: NM_001146051.1
• Aligned Length: 990
• Identities: 825
• Gaps: 165

Alignment

Query   1  ATGGCTGCTGTTGACAGTTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTATATGGAAGCTCT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCTGCTGTTGACAGTTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTATATGGAAGCTCT  74

Query  75  AGCTTTGGTTGGAGCCTGGTATACGGCCAGAAAAAGCATCACTGTCATCTGTGACTTTTACAGCCTGATCAGGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGCTTTGGTTGGAGCCTGGTATACGGCCAGAAAAAGCATCACTGTCATCTGTGACTTTTACAGCCTGATCAGGC  148

Query 149  TGCATTTTATCCCCCGCCTGGGGAGCAGAGCAGACTTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCCGTTGTCAGCGGT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGCATTTTATCCCCCGCCTGGGGAGCAGAGCAGACTTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCCGTTGTCAGCGGT  222

Query 223  GCAACAGATGGGATTGGAAAAGCCTACGCTGAAGAGTTAGCAAGCCGAGGTCTCAATATAATCCTGATTAGTCG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCAACAGATGGGATTGGAAAAGCCTACGCTGAAGAGTTAGCAAGCCGAGGTCTCAATATAATCCTGATTAGTCG  296

Query 297  GAACGAGGAGAAGTTGCAGGTTGTTGCTAAAGACATAGCCGACACGTACAAAGTGGAAACTGATATTATAGTTG  370
           |||||||||||||||                                                           
Sbjct 297  GAACGAGGAGAAGTT-----------------------------------------------------------  311

Query 371  CGGACTTCAGCAGCGGTCGTGAGATCTACCTTCCAATTCGAGAAGCCCTGAAGGACAAAGACGTTGGCATCTTG  444
                                                                                     
Sbjct 312  --------------------------------------------------------------------------  311

Query 445  GTAAATAACGTGGGTGTGTTTTATCCCTACCCGCAGTATTTCACTCAGCTGTCCGAGGACAAGCTCTGGGACAT  518
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312  --------------------------------GCAGTATTTCACTCAGCTGTCCGAGGACAAGCTCTGGGACAT  353

Query 519  CATAAATGTGAACATTGCCGCCGCTAGTTTGATGGTCCATGTTGTGTTACCGGGAATGGTGGAGAGAAAGAAAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354  CATAAATGTGAACATTGCCGCCGCTAGTTTGATGGTCCATGTTGTGTTACCGGGAATGGTGGAGAGAAAGAAAG  427

Query 593  GTGCCATCGTCACGATCTCTTCTGGCTCCTGCTGCAAACCCACTCCTCAGCTGGCTGCATTTTCTGCTTCTAAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428  GTGCCATCGTCACGATCTCTTCTGGCTCCTGCTGCAAACCCACTCCTCAGCTGGCTGCATTTTCTGCTTCTAAG  501

Query 667  GCTTATTTAGACCACTTCAGCAGAGCCTTGCAATATGAATATGCCTCTAAAGGAATCTTTGTACAGAGTCTAAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502  GCTTATTTAGACCACTTCAGCAGAGCCTTGCAATATGAATATGCCTCTAAAGGAATCTTTGTACAGAGTCTAAT  575

Query 741  CCCTTTCTATGTAGCCACCAGCATGACAGCACCCAGCAACTTTCTGCACAGGTGCTCGTGGTTGGTGCCTTCGC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576  CCCTTTCTATGTAGCCACCAGCATGACAGCACCCAGCAACTTTCTGCACAGGTGCTCGTGGTTGGTGCCTTCGC  649

Query 815  CAAAAGTCTATGCACATCATGCTGTTTCTACTCTTGGGATTTCCAAAAGGACCACAGGATATTGGTCCCATTCT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650  CAAAAGTCTATGCACATCATGCTGTTTCTACTCTTGGGATTTCCAAAAGGACCACAGGATATTGGTCCCATTCT  723

Query 889  ATTCAGTTTCTTTTTGCACAGTATATGCCTGAATGGCTCTGGGTGTGGGGAGCAAATATTCTCAACCGTTCACT  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724  ATTCAGTTTCTTTTTGCACAGTATATGCCTGAATGGCTCTGGGTGTGGGGAGCAAATATTCTCAACCGTTCACT  797

Query 963  ACGTAAGGAAGCCTTATCCTGCACAGCC  990
           ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798  ACGTAAGGAAGCCTTATCCTGCACAGCC  825