Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04287
• Subject: XM_006531394.3
• Aligned Length: 1048
• Identities: 806
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGCTGCTGTTGACAG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGAATGGCCGCGCTGCTGAAGAAAGCGCGCAGCTTCTGCAGAGCCCGGTCGCCATGGCTGCTGTTGACAG  74

Query   18  TTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTATATGGAAGCTCTAGCTTTGGTTGGAGCCT  91
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||.|||||||
Sbjct   75  CTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTACATGGAAGCCTTGGCCTTGGTGGGAGCCT  148

Query   92  GGTATACGGCCAGAAAAAGCATCACTGTCATCTGTGACTTTTACAGCCTGATCAGGCTGCATTTTATCCCCCGC  165
            ||||.||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  149  GGTACACAGCCCGAAAGAGCATCACCGTCATCTGTGACTTCTACAGCCTGGTCAGGCTGCACTTCATCCCTCGC  222

Query  166  CTGGGGAGCAGAGCAGACTTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCCGTTGTCAGCGGTGCAACAGATGGGATTGG  239
            |||||||||||..|.|||.|||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  223  CTGGGGAGCAGGCCCGACCTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCGGTCATCAGTGGGGCCACCGATGGCATTGG  296

Query  240  AAAAGCCTACGCTGAAGAGTTAGCAAGCCGAGGTCTCAATATAATCCTGATTAGTC-GGAACGAGGAGAAGTTG  312
            .||.|||||.||.||.||||||||.||||..||.||||||.|.||||||||.||.| |||| |||||||||.||
Sbjct  297  GAAGGCCTATGCGGAGGAGTTAGCGAGCCACGGACTCAATGTCATCCTGATCAGCCAGGAA-GAGGAGAAGCTG  369

Query  313  CAGGTTGTTGCTAAAGACATAGCCGACACGTACAAAGTGGAAACTGATATTATAGTTGCGGACTTCAGCAGCGG  386
            ||||..|..||.||..|||||||||||||.||||..||.||.||...|.|..|.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  370  CAGGCCGCGGCCAAGCACATAGCCGACACCTACAGGGTAGAGACGCTTGTCCTGGTGGCAGACTTCAGCAGAGG  443

Query  387  TCGTGAGATCTACCTTCCAATTCGAGAAGCCCTGAAGGACAAAGACGTTGGCATCTTGGTAAATAACGTGGGTG  460
            .||.|||||.|||...||.||.|||||||||||||..||||.||||.||||||||.||||.||..|||||||||
Sbjct  444  CCGGGAGATTTACGCCCCCATCCGAGAAGCCCTGAGAGACAGAGACATTGGCATCCTGGTGAACGACGTGGGTG  517

Query  461  TGTTTTATCCCTACCCGCAGTATTTCACTCAGCTGTCCGAGGACAAGCTCTGGGACATCATAAATGTGAACATT  534
            ..||.||.||||||||.||||||||||..|||.||.|||||||||.|||||||||||||.|.||.||||||||.
Sbjct  518  CATTCTACCCCTACCCTCAGTATTTCAGCCAGGTGCCCGAGGACACGCTCTGGGACATCGTGAACGTGAACATC  591

Query  535  GCCGCCGCTAGTTTGATGGTCCATGTTGTGTTACCGGGAATGGTGGAGAGAAAGAAAGGTGCCATCGTCACGAT  608
            ||.|||||.||..|||||||.||..|.|||.|.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|
Sbjct  592  GCAGCCGCCAGCCTGATGGTGCACATCGTGCTGCCAGGGATGGTGGAGAGAAAGAAGGGCGCCATCGTCACCGT  665

Query  609  CTCTTCTGGCTCCTGCTGCAAACCCACTCCTCAGCTGGCTGCATTTTCTGCTTCTAAGGCTTATTTAGACCACT  682
            .||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||
Sbjct  666  GTCTTCTGGTTCCTGCTGCAAGCCCACCCCACAGCTGGCTGCCTTCTCTGCGTCCAAGGCCTATCTGGACCACT  739

Query  683  TCAGCAGAGCCTTGCAATATGAATATGCCTCTAAAGGAATCTTTGTACAGAGTCTAATCCCTTTCTATGTAGCC  756
            |||||.|||||.||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||..||
Sbjct  740  TCAGCCGAGCCCTGCAGTACGAGTATGCCTCTAAGGGGATCTTTGTGCAGAGCCTGATCCCCTTCTACGTGACC  813

Query  757  ACCAGCATGACAGCACCCAGCAACTTTCTGCACAGGTGCTCGTGGTTGGTGCCTTCGCCAAAAGTCTATGCACA  830
            |.||||..|.|.||.|||..||.|||.||||||||.|||.|||||.|||.|||.|||||.|.|||.||||||||
Sbjct  814  AGCAGCGGGGCTGCGCCCGCCAGCTTCCTGCACAGATGCCCGTGGCTGGCGCCGTCGCCGAGAGTGTATGCACA  887

Query  831  TCATGCTGTTTCTACTCTTGGGATTTCCAAAAGGACCACAGGATATTGGTCCCATTCTATTCAGTTTCTTTTTG  904
            .|||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct  888  GCATGCAGTGTCGACCCTGGGCATTTCAAAAAGGACCACAGGCTACTGGTCCCATTCCATTCAGTTCCTCTTCG  961

Query  905  CACAGTATATGCCTGAATGGCTCTGGGTGTGGGGAGCAAATATTCTCAACCGTTCACTACGTAAGGAAGCCTTA  978
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.||..||||.||.||.||||||
Sbjct  962  CACAGTATATGCCCGAGTGGCTCTGGGTGTGGGGTGCAAACCTCCTCAACCGCTCCTTACGGAAAGAGGCCTTA  1035

Query  979  TCCTGCACAGCC  990
            ||||||..||||
Sbjct 1036  TCCTGCCAAGCC  1047