Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04287
• Subject: XM_006531396.1
• Aligned Length: 991
• Identities: 806
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGGCTGCTGTTGACAGTTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTATATGGAAGCTCT  74
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|
Sbjct   1  ATGGCTGCTGTTGACAGCTTCTACCTCTTGTACAGGGAAATCGCCAGGTCTTGCAATTGCTACATGGAAGCCTT  74

Query  75  AGCTTTGGTTGGAGCCTGGTATACGGCCAGAAAAAGCATCACTGTCATCTGTGACTTTTACAGCCTGATCAGGC  148
           .||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  75  GGCCTTGGTGGGAGCCTGGTACACAGCCCGAAAGAGCATCACCGTCATCTGTGACTTCTACAGCCTGGTCAGGC  148

Query 149  TGCATTTTATCCCCCGCCTGGGGAGCAGAGCAGACTTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCCGTTGTCAGCGGT  222
           ||||.||.|||||.||||||||||||||..|.|||.|||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.
Sbjct 149  TGCACTTCATCCCTCGCCTGGGGAGCAGGCCCGACCTGATCAAGCAGTATGGAAGATGGGCGGTCATCAGTGGG  222

Query 223  GCAACAGATGGGATTGGAAAAGCCTACGCTGAAGAGTTAGCAAGCCGAGGTCTCAATATAATCCTGATTAGTC-  295
           ||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||..||.||||||.|.||||||||.||.| 
Sbjct 223  GCCACCGATGGCATTGGGAAGGCCTATGCGGAGGAGTTAGCGAGCCACGGACTCAATGTCATCCTGATCAGCCA  296

Query 296  GGAACGAGGAGAAGTTGCAGGTTGTTGCTAAAGACATAGCCGACACGTACAAAGTGGAAACTGATATTATAGTT  369
           |||| |||||||||.||||||..|..||.||..|||||||||||||.||||..||.||.||...|.|..|.||.
Sbjct 297  GGAA-GAGGAGAAGCTGCAGGCCGCGGCCAAGCACATAGCCGACACCTACAGGGTAGAGACGCTTGTCCTGGTG  369

Query 370  GCGGACTTCAGCAGCGGTCGTGAGATCTACCTTCCAATTCGAGAAGCCCTGAAGGACAAAGACGTTGGCATCTT  443
           ||.|||||||||||.||.||.|||||.|||...||.||.|||||||||||||..||||.||||.||||||||.|
Sbjct 370  GCAGACTTCAGCAGAGGCCGGGAGATTTACGCCCCCATCCGAGAAGCCCTGAGAGACAGAGACATTGGCATCCT  443

Query 444  GGTAAATAACGTGGGTGTGTTTTATCCCTACCCGCAGTATTTCACTCAGCTGTCCGAGGACAAGCTCTGGGACA  517
           |||.||..|||||||||..||.||.||||||||.||||||||||..|||.||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 444  GGTGAACGACGTGGGTGCATTCTACCCCTACCCTCAGTATTTCAGCCAGGTGCCCGAGGACACGCTCTGGGACA  517

Query 518  TCATAAATGTGAACATTGCCGCCGCTAGTTTGATGGTCCATGTTGTGTTACCGGGAATGGTGGAGAGAAAGAAA  591
           ||.|.||.||||||||.||.|||||.||..|||||||.||..|.|||.|.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 518  TCGTGAACGTGAACATCGCAGCCGCCAGCCTGATGGTGCACATCGTGCTGCCAGGGATGGTGGAGAGAAAGAAG  591

Query 592  GGTGCCATCGTCACGATCTCTTCTGGCTCCTGCTGCAAACCCACTCCTCAGCTGGCTGCATTTTCTGCTTCTAA  665
           ||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 592  GGCGCCATCGTCACCGTGTCTTCTGGTTCCTGCTGCAAGCCCACCCCACAGCTGGCTGCCTTCTCTGCGTCCAA  665

Query 666  GGCTTATTTAGACCACTTCAGCAGAGCCTTGCAATATGAATATGCCTCTAAAGGAATCTTTGTACAGAGTCTAA  739
           |||.|||.|.||||||||||||.|||||.||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 666  GGCCTATCTGGACCACTTCAGCCGAGCCCTGCAGTACGAGTATGCCTCTAAGGGGATCTTTGTGCAGAGCCTGA  739

Query 740  TCCCTTTCTATGTAGCCACCAGCATGACAGCACCCAGCAACTTTCTGCACAGGTGCTCGTGGTTGGTGCCTTCG  813
           ||||.|||||.||..|||.||||..|.|.||.|||..||.|||.||||||||.|||.|||||.|||.|||.|||
Sbjct 740  TCCCCTTCTACGTGACCAGCAGCGGGGCTGCGCCCGCCAGCTTCCTGCACAGATGCCCGTGGCTGGCGCCGTCG  813

Query 814  CCAAAAGTCTATGCACATCATGCTGTTTCTACTCTTGGGATTTCCAAAAGGACCACAGGATATTGGTCCCATTC  887
           ||.|.|||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 814  CCGAGAGTGTATGCACAGCATGCAGTGTCGACCCTGGGCATTTCAAAAAGGACCACAGGCTACTGGTCCCATTC  887

Query 888  TATTCAGTTTCTTTTTGCACAGTATATGCCTGAATGGCTCTGGGTGTGGGGAGCAAATATTCTCAACCGTTCAC  961
           .||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.||..
Sbjct 888  CATTCAGTTCCTCTTCGCACAGTATATGCCCGAGTGGCTCTGGGTGTGGGGTGCAAACCTCCTCAACCGCTCCT  961

Query 962  TACGTAAGGAAGCCTTATCCTGCACAGCC  990
           ||||.||.||.||||||||||||..||||
Sbjct 962  TACGGAAAGAGGCCTTATCCTGCCAAGCC  990