Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04314
• Subject: NM_001163418.1
• Aligned Length: 1248
• Identities: 918
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGAAAAAAG  10

Query  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  84

Query  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  158

Query  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  232

Query  371  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  444
            |||||                                                                     
Sbjct  233  TTCCA---------------------------------------------------------------------  237

Query  445  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  518
                                                                                      
Sbjct  238  --------------------------------------------------------------------------  237

Query  519  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  592
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  -------------------------------------------------GAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  262

Query  593  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  336

Query  667  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  410

Query  741  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  484

Query  815  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  558

Query  889  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  632

Query  963  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  706

Query 1037  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  780

Query 1111  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  854

Query 1185  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  918