Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04314
• Subject: NM_138312.1
• Aligned Length: 1252
• Identities: 1124
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTCTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATGCAGCAGGGAGGTTC  74

Query   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148
            |.||||||.||||.|||||.|.|||.||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  AAATGAAACAGAACAGACTGCAGCATTGAAAGATTTGCTGTCTAGGATCGATTTGGATGAACTCATGAAAAAGG  148

Query  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222
            |.|||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGAACCACCTTTTGATTTTCCAGATACACTGGAAGGCTTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGGCAGTTAAGA  222

Query  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGAGAAGACTTACACAGGTGGAACCAGAAAAGATATGA  296

Query  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAG-TATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCT  369
            .|||||.||.||||||||||| ||| |||||.||||||||||||||||..||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct  297  AGCTCTGGGCGAGATCATCAC-AAGATATGTTTATGAGCTCCTGGAAAGTGACTGTAATTTGAAAAAAATCTCT  369

Query  370  ATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACA  443

Query  444  GAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATG  517
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  444  GAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGTCAGTGGGCTAGAAGGCTTATTATTAATG  517

Query  518  AAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||.||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  518  AAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCTTTTATTAAGAGAGCTATGGATGAAGGGTATGGAGTCATCGTCCTG  591

Query  592  AATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCA---TCTGATAGTTCAGA  662
            ||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.||.||...||||||||||   ||||||.||.||||
Sbjct  592  AACCCAAATGAAAACTATATAGAAGTGGAAAAGCAGAAAATGCATAAACAGTCATCATCTTCTGATGGTACAGA  665

Query  663  TGAACCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGA  736
            |||.|||||||..||.||||||||.|.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  666  TGAGCCAGCAGGGAAGCGGGAAAGGAGAGATAAGGTCTCCAAGGAAACAAAGAAGCGTCGTGATTTCTATGAGA  739

Query  737  AGTATCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACAT  810
            ||||.||.|||||.||||..||.||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  740  AGTACCGCAACCCTCAAAAGGAGAAAGAAATGATGCAGTTGTTTATCAGGGAAAATGGTTCTCCTGAAGAGCAT  813

Query  811  GCAATCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGG  884
            ||..|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct  814  GCGGTCTATGTGTGGGACCATTTCATAGCCCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTCTTTGTGGCTCATAGCTATGG  887

Query  885  AGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGA  958
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  888  AGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCAGATGTAAAAAGTAAGGTGACTGCTGTGGCATTGA  961

Query  959  CAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGT  1032
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACCATCCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGT  1035

Query 1033  AATTGGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGC  1106
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.||.||
Sbjct 1036  AACTGGGTCTCCAGCTCAGAACCATTAGATACATCGGTGGAATCCATGCTGCCTGACTGTCCCAGAGTGTCTGC  1109

Query 1107  AGGCACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAG  1180
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.|
Sbjct 1110  AGGCACCGACCGTCACGAGCTCACTTCCTGGAAGAGCTTCCCGTCTATCTTCAAGTTCTTCGCGGAAGCCTCGG  1183

Query 1181  AGGCCAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1248
            |||||||||.||||||.|.|||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1184  AGGCCAAGAGCAGCTCGCAGAAGCCGGCCCTGACGCGGCGCTCGCACCGGATCAAGCACGAGGAGCTG  1251