Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04314
• Subject: XM_005272105.4
• Aligned Length: 1248
• Identities: 1056
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74

Query   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148

Query  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222

Query  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296

Query  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370

Query  371  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  444
            |||||                                                                     
Sbjct  371  TTCCA---------------------------------------------------------------------  375

Query  445  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  518
                                                                                      
Sbjct  376  --------------------------------------------------------------------------  375

Query  519  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  592
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  -------------------------------------------------GAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  400

Query  593  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  474

Query  667  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  548

Query  741  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  549  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  622

Query  815  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  696

Query  889  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  770

Query  963  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  844

Query 1037  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  918

Query 1111  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  992

Query 1185  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1056