Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04314
• Subject: XM_005272110.3
• Aligned Length: 1248
• Identities: 891
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGAAAAAAG  10

Query  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  84

Query  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  158

Query  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  232

Query  371  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  306

Query  445  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  380

Query  519  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  381  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCT-------------------------  429

Query  593  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  666
                                                                                      
Sbjct  430  --------------------------------------------------------------------------  429

Query  667  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  740
                                                                                      
Sbjct  430  --------------------------------------------------------------------------  429

Query  741  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  814
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  ----------------------------------------------GAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  457

Query  815  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  531

Query  889  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  605

Query  963  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  679

Query 1037  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  753

Query 1111  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAGAGGC  827

Query 1185  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  CAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  891