Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04314
• Subject: XM_017009954.2
• Aligned Length: 1257
• Identities: 1148
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC  74

Query   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG  148

Query  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA  222

Query  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA  296

Query  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAGTATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCTA  370

Query  371  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACAG  444

Query  445  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATGA  518

Query  519  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTAA  592

Query  593  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCATCTGATAGTTCAGATGAA  666

Query  667  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGAAGTA  740

Query  741  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACATGCAA  814

Query  815  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGGAGGA  888

Query  889  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGACAGA  962

Query  963  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGTAATT  1036

Query 1037  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1037  GGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGCAG--  1108

Query 1111  ACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGA-AGA--GCTTTCCGTCT---ATTTT-CA--AATTCTTTACCGAAGC  1175
                                |||.||.| |||  ||.||  ||||   ||||| ||  |||...|.|.|.||  
Sbjct 1109  --------------------TTCATGTACAGATGGCATT--GTCTCCCATTTTACAAGAATGGATGATCAAA--  1158

Query 1176  CTCAGAGGCCAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG  1248
               ||||    ||||.                                                         
Sbjct 1159  ---AGAG----AGACT---------------------------------------------------------  1167