Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04367
Subject:
NM_001271831.1
Aligned Length:
909
Identities:
810
Gaps:
99

Alignment

Query   1  ATGGATCCTGAGGTGACCTTGCTGCTGCAGTGCCCTGGCGGGGGCCTGCCCCAGGAGCAGATACAGGCCGAGCT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATCCTGAGGTGACCTTGCTGCTGCAGTGCCCTGGCGGGGGCCTGCCCCAGGAGCAGATACAGGCCGAGCT  74

Query  75  GAGCCCCGCCCATGACCGTCGCCCACTGCCAGGTGGGGACGAGGCCATCACTGCCATCTGGGAGACCCGGCTAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAGCCCCGCCCATGACCGTCGCCCACTGCCAGGTGGGGACGAGGCCATCACTGCCATCTGGGAGACCCGGCTAA  148

Query 149  AGGCCCAACCCTGGCTCTTCGACGCCCCCAAGTTCCGCCTGCACTCAGCCACCCTGGCGCCTATTGGCTCTCGG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGGCCCAACCCTGGCTCTTCGACGCCCCCAAGTTCCGCCTGCACTCAGCCACCCTGGCGCCTATTGGCTCTCGG  222

Query 223  GGGCCACAGCTGCTCCTGCGCCTGGGCCTTACTTCCTACCGAGACTTCCTGGGCACCAACTGGTCCAGCTCAGC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGGCCACAGCTGCTCCTGCGCCTGGGCCTTACTTCCTACCGAGACTTCCTGGGCACCAACTGGTCCAGCTCAGC  296

Query 297  TGCCTGGCTGCGACAGCAGGGTGCCACCGACTGGGGTGACACGCAGGCCTATCTGGCGGACCCACTGGGGGTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGCCTGGCTGCGACAGCAGGGTGCCACCGACTGGGGTGACACGCAGGCCTATCTGGCGGACCCACTGGGGGTGG  370

Query 371  GCGCTGCACTAGCCACAGCCGATGACTTCCTTGTCTTCCTGCGCCGCTCCCGGCAGGTGGCTGAGGCCCCTGGG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GCGCTGCACTAGCCACAGCCGATGACTTCCTTGTCTTCCTGCGCCGCTCCCGGCAGGTGGCTGAGGCCCCTGGG  444

Query 445  CTGGTGGACGTACCTGGTGGGCACCCTGAGCCTCAGGCCCTGTGCCCTGGTGGCAGCCCCCAGCACCAGGACCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 445  CTGGTGGACGTACCTGGTGGGCACCCTGAGCCTC----------------------------------------  478

Query 519  CGCTGGGCAGCTGGTGGTACATGAACTCTTTTCCAGTGTCCTTCAGGAGATCTGTGATGAGGTGAACCTGCCGC  592
                                                                      |||||||||||||||
Sbjct 479  -----------------------------------------------------------AGGTGAACCTGCCGC  493

Query 593  TGCTCACCCTGAGCCAGCCCCTGCTGTTGGGCATCGCCCGAAATGAGACCAGTGCTGGCCGAGCCAGTGCCGAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494  TGCTCACCCTGAGCCAGCCCCTGCTGTTGGGCATCGCCCGAAATGAGACCAGTGCTGGCCGAGCCAGTGCCGAG  567

Query 667  TTCTATGTCCAGTGCAGCCTGACTTCTGAGCAGGTGAGGAAGCACTACCTGAGTGGGGGACCCGAGGCCCACGA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568  TTCTATGTCCAGTGCAGCCTGACTTCTGAGCAGGTGAGGAAGCACTACCTGAGTGGGGGACCCGAGGCCCACGA  641

Query 741  GTCTACAGGAATCTTCTTTGTGGAGACACAGAACGTGCGGAGATTGCCCGAGACGGAGATGTGGGCTGAACTCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642  GTCTACAGGAATCTTCTTTGTGGAGACACAGAACGTGCGGAGATTGCCCGAGACGGAGATGTGGGCTGAACTCT  715

Query 815  GCCCCTCGGCCAAAGGCGCCATCATCCTCTACAACCGGGTTCAGGGAAGTCCCACTGGAGCGGCCCTAGGGTCC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716  GCCCCTCGGCCAAAGGCGCCATCATCCTCTACAACCGGGTTCAGGGAAGTCCCACTGGAGCGGCCCTAGGGTCC  789

Query 889  CCAGCCCTACTCCCGCCGCTC  909
           |||||||||||||||||||||
Sbjct 790  CCAGCCCTACTCCCGCCGCTC  810