Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04392
• Subject: NM_001130525.1
• Aligned Length: 2023
• Identities: 1751
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCCATTGTGCAGACTCTGCCAGTGCCACTGGAGCCTGCTCCTGAAGCTGCCACTGCCCCACAAGCTCCAGT  74
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|.|||..|.|||||||||||..||.||||||.
Sbjct    1  ATGGCCATTGTGCACACTCTGCCAGTGCCTCTGGAGCCCGCACGTGAGACAGCCACTGCCCCCAAAACTCCAGC  74

Query   75  CATGGGTAGTGTGAGCAGCCTTATCTCAGGCCGGCCCTGTCCCGGGGGGCCAGCTCCTCCCCGCCACCACGGCC  148
            .|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||..||.||.||.||..
Sbjct   75  AATGGGCAGCGTGAGCAGTCTTATCTCAGGCCGGCCCTGCCCCGGGGGACCTGCTCCTCAACGACATCATGGTG  148

Query  149  CTCCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGCCTGCTACGGGGTGGCTATGAGGCACAGGAGCCGCTGTGC  222
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TCCCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGGCTGCTACCGGGTGGCTACGAGGCACAGGAACCGCTCTGC  222

Query  223  CCAGCTGTGCCCCCTAGGAAGGCTGTCCCTGTCACCAGCTTCACCTACATCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTC  296
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.|.||..|||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGGCTGTGCCACCGAGGAAGGCTGTCCCAGGCAATAGCTTTACCTATGTCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTC  296

Query  297  ACCCCCCAGCCCAAGCAGTGATGTTGAGGATGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAATGCCCACCTCCGCGGCCCAC  370
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  297  TCCTCCCAGCCCCAGCAGTGATGTTGAAGATCCCCGGGAACATCAGGCACACAATGCCCACCTCCGTGGGCCCC  370

Query  371  CACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGCTGGAGAAGAACATGGAGAAGATCCTGATCCGCCCAACAGCCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGCTGGAGAAGAATATGGAGAAGATCCTGATCCGGCCAACAGCCTTC  444

Query  445  AAGCCAGTGCTGCCCAAACCTCGAGGGGCTCCGTCCCTGCCTAGCTTCATGGGTCCTCGGGCCACCGGGCTGTC  518
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||..|||||.|.||||||||.||..|.|||||.||
Sbjct  445  AAGCCAGTGCTACCCAAACCTCGGGGGGCGCCATCCCTACCCGGCTTCCTTGGTCCTCGAGCTGCTGGGCTATC  518

Query  519  TGGGAGCCAGGGCAGCCTGACGCAGCTGTTTGGGGGCCCTGCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCAG  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  TGGGAGCCAGGGCAGCCTGACACAGCTGTTTGGGGGGCCAGCCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCTCCTCTG  592

Query  593  CTGCTGACAAACCCCTGGCATTTAGTGGCTGGGCCAGTGGCTGCCCATCAGGGACGCTATCCGACTCTGGCCGA  666
            ||||||||||||||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  593  CTGCTGACAAACCCTTGGCACTGAGTGGTTGGGCCAGTGGCTGCCCTTCAGGAACGCTGTCAGACTCTGGCCGA  666

Query  667  AACTCACTGTCCAGCCTGCCCACCTACAGCACCGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAGCTCCCCAGGCGGGCACCT  740
            ||.||..|.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct  667  AATTCTTTATCCAGCTTGCCCACCTACAGCACTGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAACTCCCCAGGTGGGCACCT  740

Query  741  GCCTTCCCATGGCTCTGGGCGAGGGGCACTGCCTGGGCCAGCCCGAGGGGTCCCTACTGGGCCCTCCCACTCAG  814
            |||.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  GCCCTCCCACGGCCCTGGCCGAGGGGCACTGCCTGGTCCAGCCCGAGGGGTCCCTACTGGGCCCTCCCATTCAG  814

Query  815  ACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAGAGCACAGGCTCCCTAGGGGGCCGTGTGGCTGGGGGGCTTTTGGGCAGT  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  ACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAAAGCACGGGCTCCTTGGGGGGTCGTGTAGCTGGGGGGCTCTTGGGCAGT  888

Query  889  GGTACTCGGGCCTCCCCTGACAGCAGCTCCTGTGGGGAGCGCTCACCACCACCC----CCGCCTCCACCTCCTT  958
            |||.|.|||||||||||||.||||||.||..||||.||.|||||.||||| |||    ||.||||||||.||||
Sbjct  889  GGTGCCCGGGCCTCCCCTGGCAGCAGTTCTGGTGGAGACCGCTCTCCACC-CCCTCCACCACCTCCACCCCCTT  961

Query  959  CGGATGAGGCCCTGCTGCACTGTGTCCTGGAAGGAAAGCTCCGAGACCGGGAGGCAGAGCTTCAGCAGCTGCGG  1032
            |||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  962  CGGATGAGGCCTTGCTACACTGTGTCCTGGAAGGGAAGCTCAGAGACCGCGAGGCAGAGCTGCAGCAGCTGCGG  1035

Query 1033  GACAGTCTGGACGAGAATGAGGCTACCATGTGCCAGGCATACGAGGAGCGGCAGCGGCACTGGCAGCGAGAGCG  1106
            ||||||.||||.||||.||||||.||..||||.|||||||.||.||..||||||||||.|||||..||.|||||
Sbjct 1036  GACAGTATGGATGAGAGTGAGGCCACAGTGTGTCAGGCATTCGGGGCACGGCAGCGGCGCTGGCCACGGGAGCG  1109

Query 1107  TGAGGCCCTGCGAGAGGACTGTGCGGCCCAGGCACAGCGGGC------------ACAGCGGGCCCAACAGCTGC  1168
            .|         |.|||||||||||.||||||||.||||.|||            .|||||||||||||||||||
Sbjct 1110  AG---------GGGAGGACTGTGCAGCCCAGGCGCAGCAGGCCACGCAGCGCGTCCAGCGGGCCCAACAGCTGC  1174

Query 1169  TGCAGCTGCAGGTGTTCCAGCTGCAGCAGGAGAAGCGGCAATTGCAGGACGACTTCGCACAGCTGCTGCAGGAG  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1175  TGCAGCTGCAGGTGTTCCAGCTGCAGCAAGAGAAGCGCCAGTTGCAGGATGACTTTGCCCAGCTGCTACAGGAG  1248

Query 1243  CGCGAACAGCTGGAGCGGCGCTGCGCCACCTTGGAGCGGGAGCAGCGGGAGCTCGGGCCGAGGCTTGAGGAGAC  1316
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||
Sbjct 1249  CGGGAACAGCTGGAGCGCCGCTGTGCCACTTTTGAACGGGAGCAGCGGGAACTCGGGCCACGGCTGGAGGAGAC  1322

Query 1317  CAAGTGGGAGGTGTGCCAGAAATCAGGCGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAGCTGAAAGAGTCTCAGGCAGAGC  1390
            |||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1323  CAAATGGGAGGTGTGTCAGAAATCAGGTGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAACTGAAGGAATCTCAGGCAGAGC  1396

Query 1391  TGGTGCAGAAGGGCAGCGAGCTGGTGGCTCTGCGGGTGGCGCTGCGGGAGGCCCGTGCTACGCTGCGGGTCAGT  1464
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||..|||||||||||
Sbjct 1397  TGGTCCAGAAGGGCAGTGAGCTGGTGGCGCTGCGGGTGGCCCTCCGTGAGGCCCGGGCCACCTTGCGGGTCAGT  1470

Query 1465  GAGGGCCGTGCGCGGGGTCTACAGGAGGCCGCCCGAGCTCGGGAGCTGGAGCTGGAAGCCTGTTCCCAGGAGCT  1538
            |||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1471  GAGGGCCGTGCCAGGGGCCTGCAGGAGGCAGCCCGAGCTCGGGAGCAGGAGCTGGAGGCCTGCTCGCAGGAGCT  1544

Query 1539  GCAGCGACACCGCCAGGAAGCTGAGCAGCTGCGGGAGAAAGCTGGGCAGTTGGATGCTGAGGCGGCCGGACTCC  1612
            .|||||..||||||||||.|||||||.|||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||..|.|||||||
Sbjct 1545  TCAGCGGTACCGCCAGGAGGCTGAGCGGCTCCGGGAGAAGGCCGGGCATTTGGATGCCGAAGCATCGGGACTCC  1618

Query 1613  GGGAGCCCCCTGTGCCACCTGCCACCGCTGACCCATTCCTCCTGGCAGAGAGTGATGAGGCCAAAGTGCAGCGG  1686
            ||||.||||||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1619  GGGATCCCCCTGTACCCCCTGCCACCACCGACCCGTTCCTCCTGGCAGAGAGTGATGAGGCCAAGGTGCAGCGG  1692

Query 1687  GCAGCAGCCGGGGTTGGGGGCAGCTTGCGGGCCCAGGTGGAGCGATTGCGGGTGGAGCTGCAGCGGGAGCGGCG  1760
            |||||.||.||||..|||||.|||.|||||||.||||||||.||..||||....||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1693  GCAGCGGCTGGGGCAGGGGGTAGCCTGCGGGCTCAGGTGGAACGGCTGCGCCAAGAACTGCAGCGGGAGCAGCG  1766

Query 1761  GCGGGGTGAGGAGCAGCGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGAGCAGGTGATCC  1834
            |||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1767  GCGAGGGGACGAGCAACGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGAACAGGTGATCC  1840

Query 1835  GCTACCAGAAGCAGCTGCAGCACAACTACATCCAGATGTACCGGCGCAACCGGCAGCTAGAGCAGGAGCTGCAG  1908
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1841  GCTACCAGAAGCAGCTGCAGCACAACTATATCCAGATGTACCGGCGTAACCGGCAGCTGGAGCAGGAACTGCAG  1914

Query 1909  CAGCTCAGCCTGGAGCTGGAGGCCCGGGAGCTCGCTGACCTGGGCCTGGCCGAGCAGGCCCCCTGCATCTGCCT  1982
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||||||||.|||..||||||.||||||||.||
Sbjct 1915  CAACTGAGCCTGGAGCTGGAGGCCCGCGAGCTTGCGGATTTGGGCCTGGCGGAGTCGGCCCCTTGCATCTGTCT  1988

Query 1983  GGAGGAGATCACTGCTACTGAGATC  2007
            |||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1989  GGAGGAGATCACTGCCACTGAGATC  2013