Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04403
• Subject: NM_001346115.2
• Aligned Length: 1083
• Identities: 923
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT  74

Query   75  GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC  148

Query  149  TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC  222

Query  223  AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT  296

Query  297  CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG  370

Query  371  GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA  444

Query  445  CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA  518

Query  519  CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA  592

Query  593  TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG  666

Query  667  GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC  740

Query  741  TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA  814

Query  815  CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC  888

Query  889  AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGACAGAGAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.                                      
Sbjct  889  AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGG--------------------------------------  924

Query  963  ACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTATGGAGTTGTG  1036
                                                                                      
Sbjct  925  --------------------------------------------------------------------------  924

Query 1037  GATTTAGAACTGCTTTGGTGGTTGGAGGAATTGCTACTGTGTATGAA  1083
                                                           
Sbjct  925  -----------------------------------------------  924