Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04403
• Subject: XM_024450302.1
• Aligned Length: 1527
• Identities: 1059
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT  74

Query   75  GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC  148

Query  149  TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC  222

Query  223  AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT  296

Query  297  CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG  370

Query  371  GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA  444

Query  445  CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA  518

Query  519  CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA  592

Query  593  TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG  666

Query  667  GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC  740

Query  741  TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA  814

Query  815  CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC  888

Query  889  AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGACAGAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGACAGAGAG  962

Query  963  ACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTATG--GAGTTG  1034
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  
Sbjct  963  ACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTA-GAAGAGT--  1033

Query 1035  TGGATTTAGAACTGCTTTGGTGGTTGGAGGAA-TTGCTACTGT---GTAT------------GAA---------  1083
                       |.||..||.||   ||||.|| |.|||| |||   ||||            |||         
Sbjct 1034  -----------CAGCAATGATG---GGAGTAAGTGGCTA-TGTGGAGTATCTCCGAGAGCAGGAAGTATCTGAG  1092

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1093  CGGTGGTTCCGGTACAACCCTCGTCTCACCTGCATCTATTGCGCCAAATCTTTCAACCAGAAGGGAAGCCTGGA  1166

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1167  CCGCCACATGCGCCTACACATGGGGATCACACCATTCGTCTGCCGCATGTGTGGCAAGAAGTATACCCGGAAAG  1240

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1241  ATCAGCTGGAGTATCATATCCGCAAGCACACAGGCAACAAGCCCTTTCACTGTCATGTCTGTGGCAAAAGTTTC  1314

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1315  CCCTTCCAGGCCATCTTGAATCAGCACTTTCGCAAAAACCACCCTGGCTGTATACCCCTGGAGGGGCCTCACAG  1388

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1389  CATCTCCCCTGAAACAACTGTCACATCTCGAGGACAAGCTGAGGAAGAGTCACCTTCACAGGAAGAGACAGTTG  1462

Query 1084  -----------------------------------------------  1083
                                                           
Sbjct 1463  CTCCTGGGGAAGCTGTCCAGGGCTCTGTGTCCACCACTGGGCCAGAC  1509