Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04417
- Subject:
- XM_017023790.1
- Aligned Length:
- 1569
- Identities:
- 1136
- Gaps:
- 432
Alignment
Query 1 ATGCAGCGGGCGGCGGCGCTGGTCCGGCGGGGCTGTGGTCCCCGGACCCCCAGCTCCTGGGGCCGCAGCCAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAGCGCGGCCGCCGAGGCCTCGGCGGTGCTCAAGGTGCGGCCCGAGCGCAGCCGGCGCGAGCGCATCCTCACGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGAGTCCATGAACCCGCAGGTGAAGGCGGTGGAGTACGCCGTGCGGGGACCCATCGTGCTCAAGGCCGGCGAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATCGAGCTCGAGCTGCAGCGGGGTATCAAAAAGCCATTCACAGAGGTCATCCGAGCCAACATCGGGGACGCCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGCTATGGGGCAGCAGCCAATCACCTTCCTCCGGCAGGTGATGGCACTATGCACCTACCCAAACCTGCTGGACA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GCCCCAGCTTCCCAGAAGATGCTAAGAAACGTGCCCGGCGGATCCTGCAGGCTTGTGGCGGGAACAGCCTGGGG 444
|.|| ||| |||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------ATGC---------GAA-----TGGGG 12
Query 445 TCCTACAGTGCTAGCCAGGGTGTCAACTGCATCCGTGAAGATGTGGCTGCCTACATCACCAGGAGGGATGGCGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 TCCTACAGTGCTAGCCAGGGTGTCAACTGCATCCGTGAAGATGTGGCTGCCTACATCACCAGGAGGGATGGCGG 86
Query 519 TGTGCCTGCGGACCCCGACAACATCTACCTGACCACGGGAGCTAGTGACGGCATTTCTACGATCCTGAAGATCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 TGTGCCTGCGGACCCCGACAACATCTACCTGACCACGGGAGCTAGTGACGGCATTTCTACGATCCTGAAGATCC 160
Query 593 TCGTCTCCGGGGGCGGCAAGTCACGGACAGGTGTGATGATCCCCATCCCACAATATCCCCTCTATTCAGCTGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 TCGTCTCCGGGGGCGGCAAGTCACGGACAGGTGTGATGATCCCCATCCCACAATATCCCCTCTATTCAGCTGTC 234
Query 667 ATCTCTGAGCTCGACGCCATCCAGGTGAATTACTACCTGGACGAGGAGAACTGCTGGGCGCTGAATGTGAATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 ATCTCTGAGCTCGACGCCATCCAGGTGAATTACTACCTGGACGAGGAGAACTGCTGGGCGCTGAATGTGAATGA 308
Query 741 GCTCCGGCGGGCGGTGCAGGAGGCCAAAGACCACTGTGATCCTAAGGTGCTCTGCATAATCAACCCTGGGAACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 GCTCCGGCGGGCGGTGCAGGAGGCCAAAGACCACTGTGATCCTAAGGTGCTCTGCATAATCAACCCTGGGAACC 382
Query 815 CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATCCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTCTTTCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATCCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTCTTTCTC 456
Query 889 CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGATTGCAGATTCCACTCCTTCAAGAAGGTGCTGTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGATTGCAGATTCCACTCCTTCAAGAAGGTGCTGTA 530
Query 963 CGAGATGGGGCCCGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 CGAGATGGGGCCCGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG 604
Query 1037 AGTGTGGTTACAGAGGAGGCTACATGGAGGTGATCAACCTGCACCCTGAGATCAAGGGCCAGCTGGTGAAGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 AGTGTGGTTACAGAGGAGGCTACATGGAGGTGATCAACCTGCACCCTGAGATCAAGGGCCAGCTGGTGAAGCTG 678
Query 1111 CTGTCGGTGCGCCTGTGCCCCCCAGTGTCTGGGCAGGCCGCCATGGACATTGTCGTGAACCCCCCGGTGGCAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 CTGTCGGTGCGCCTGTGCCCCCCAGTGTCTGGGCAGGCCGCCATGGACATTGTCGTGAACCCCCCGGTGGCAGG 752
Query 1185 AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCCGAGAGAAGGAGTCGGTCCTGGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCCGAGAGAAGGAGTCGGTCCTGGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA 826
Query 1259 CGGAAGACCTGTTTAACCAAGTCCCAGGAATTCACTGCAACCCCTTGCAGGGGGCCATGTACGCCTTCCCTCGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 CGGAAGACCTGTTTAACCAAGTCCCAGGAATTCACTGCAACCCCTTGCAGGGGGCCATGTACGCCTTCCCTCGG 900
Query 1333 ATCTTCATTCCTGCCAAAGCTGTGGAGGCTGCTCAGGCCCATCAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATCTTCATTCCTGCCAAAGCTGTGGAGGCTGCTCAGGCCCATCAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA 974
Query 1407 GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCCGGCAGTGGCTTTGGGCAGAGGGAAGGCACTTACCACTTCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCCGGCAGTGGCTTTGGGCAGAGGGAAGGCACTTACCACTTCA 1048
Query 1481 GGATGACTATCCTCCCTCCAGTGGAGAAGCTGAAAACGGTGCTGCAGAAGGTGAAAGACTTCCACATCAACTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 GGATGACTATCCTCCCTCCAGTGGAGAAGCTGAAAACGGTGCTGCAGAAGGTGAAAGACTTCCACATCAACTTC 1122
Query 1555 CTGGAGAAGTACGCG 1569
|||||||||||||||
Sbjct 1123 CTGGAGAAGTACGCG 1137