Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04448
Subject:
NM_172601.3
Aligned Length:
652
Identities:
596
Gaps:
8

Alignment

Query   1  ATGACTTATGCTTATCTCTTCAAGTATATCATCATCGGAGACACAGGTGTGGGGAAGTCATGTCTCCTCCTGCA  74
           ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGACTTACGCTTATCTCTTCAAGTACATCATCATCGGAGACACAGGTGTGGGGAAGTCATGTCTCCTCCTTCA  74

Query  75  GTTTACAGATAAGCGGTTCCAGCCTGTCCACGACCTCACAATAGGTGTGGAGTTTGGAGCTCGTATGGTCAACA  148
           ||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  75  GTTTACCGACAAGCGGTTCCAGCCCGTGCACGACCTCACAATAGGTGTGGAGTTTGGAGCACGTATGGTCAACA  148

Query 149  TTGATGGAAAACAAATCAAACTGCAAATCTGGGATACGGCTGGGCAAGAATCCTTCCGTTCTATCACCCGTTCC  222
           |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TCGATGGAAAACAAATCAAACTGCAAATCTGGGATACGGCTGGGCAAGAGTCCTTCCGTTCTATCACCCGTTCC  222

Query 223  TACTACAGGGGAGCAGCTGGAGCACTGCTGGTGTACGACATTACAAGGCGTGAAACCTTCAACCACCTGACCTC  296
           |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TACTACAGGGGAGCAGCTGGAGCCCTGCTGGTGTATGACATCACGAGACGCGAAACCTTCAACCACCTGACCTC  296

Query 297  ATGGTTAGAGGATGCCCGGCAGCACTCTAGTTCCAACATGGTTATCATGCTCATTGGGAATAAGAGTGACCTAG  370
           ||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297  ATGGTTAGAGGACGCCCGCCAGCACTCCAGCTCCAACATGGTTATAATGCTGATCGGGAATAAGAGTGATCTAG  370

Query 371  AGTCCCGCAGGGATGTGAAGAGAGAAGAAGGAGAGGCCTTTGCTAGGGAGCATGGACTTATATTCATGGAAACT  444
           |.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371  AATCTCGAAGGGATGTGAAGAGAGAGGAAGGAGAGGCCTTTGCTCGTGAGCACGGCCTTATATTCATGGAAACA  444

Query 445  TCAGCCAAAACAGCCTGCAATGTTGAAGAGGCCTTCATTAACACAGCCAAAGAAATATATAGGAAGATCCAGCA  518
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TCAGCCAAGACAGCCTGCAATGTTGAAGAGGCCTACATTAATACAGCCAAAGAAATATATAGGAAGATCCAGCA  518

Query 519  GGGTTTATTTGATGTCCACAATGAGGCAAATGGCATCAAGATTGGGCCCCAACAGTCAATTTCAACATCAGTGG  592
           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|..|.|||||.|
Sbjct 519  AGGTTTATTTGATGTCCACAATGAGGCAAATGGCATCAAGATTGGGCCCCAGCAGTCAATTACCTCCTCAGTAG  592

Query 593  GACCCAGTGCCTCC---CAGCGGAAC-TCTCGTGACATAGGGTCCAACTCTGGCTGCTGC  648
           ||||  ||| ||||   ||||.|||| |.|| ||||||||||.|..||||||||||||||
Sbjct 593  GACC--GTG-CTCCCCTCAGCAGAACGTTTC-TGACATAGGGCCTGACTCTGGCTGCTGC  648