Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04452
• Subject: NM_001286378.1
• Aligned Length: 1302
• Identities: 1134
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGCCGAACCGTAAGGCCAGCCGGAATGCTTACTATTTCTTCGTGCAGGAGAAGATCCCCGAACTACGGCGACG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGGCCTGCCTGTGGCTCGCGTTGCTGATGCCATCCCTTACTGCTCCTCAGACTGGGCGCTTCTGAGGGAGGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAAAGGAGAAATACGCAGAAATGGCTCGAGAATGGAGGGCCGCTCAGGGAAAGGACCCTGGGCCCTCAGAGAAG  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGGCTCGAGAATGGAGGGCCGCTCAGGGAAAGGACCCTGGGCCCTCAGAGAAG  54

Query  223  CAGAAACCTGTTTTCACACCACTGAGGAGGCCAGGCATGCTTGTACCAAAGCAGAATGTTTCACCTCCAGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  CAGAAACCTGTTTTCACACCACTGAGGAGGCCAGGCATGCTTGTACCAAAGCAGAATGTTTCACCTCCAGATAT  128

Query  297  GTCAGCTTTGTCTTTAAAAGGTGATCAAGCTCTCCTTGGAGGCATTTTTTATTTTTTGAACATTTTTAGCCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GTCAGCTTTGTCTTTAAAAGGTGATCAAGCTCTCCTTGGAGGCATTTTTTATTTTTTGAACATTTTTAGCCATG  202

Query  371  GCGAGCTACCTCCTCATTGTGAACAGCGCTTCCTCCCTTGTGAAATTGGCTGTGTTAAGTATTCTCTCCAAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GCGAGCTACCTCCTCATTGTGAACAGCGCTTCCTCCCTTGTGAAATTGGCTGTGTTAAGTATTCTCTCCAAGAA  276

Query  445  GGTATTATGGCAGATTTCCACAGTTTTATAAATCCTGGTGAAATTCCACGAGGATTTCGATTTCATTGTCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  GGTATTATGGCAGATTTCCACAGTTTTATAAATCCTGGTGAAATTCCACGAGGATTTCGATTTCATTGTCAGGC  350

Query  519  TGCAAGTGATTCTAGTCACAAGATTCCTATTTCAAATTTTGAACGTGGGCATAACCAAGCAACTGTGTTACAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  TGCAAGTGATTCTAGTCACAAGATTCCTATTTCAAATTTTGAACGTGGGCATAACCAAGCAACTGTGTTACAAA  424

Query  593  ACCTTTATAGATTTATTCATCCCAACCCAGGGAACTGGCCACCTATCTACTGCAAGTCTGATGATAGAACCAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  ACCTTTATAGATTTATTCATCCCAACCCAGGGAACTGGCCACCTATCTACTGCAAGTCTGATGATAGAACCAGA  498

Query  667  GTCAACTGGTGTTTGAAGCATATGGCAAAGGCATCAGAAATCAGGCAAGATCTACAACTTCTCACTGTAGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  GTCAACTGGTGTTTGAAGCATATGGCAAAGGCATCAGAAATCAGGCAAGATCTACAACTTCTCACTGTAGAGGA  572

Query  741  CCTTGTAGTGGGGATCTACCAACAAAAATTTCTCAAGGAGCCCTCTAAGACTTGGATTCGAAGCCTCCTAGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  CCTTGTAGTGGGGATCTACCAACAAAAATTTCTCAAGGAGCCCTCTAAGACTTGGATTCGAAGCCTCCTAGATG  646

Query  815  TGGCCATGTGGGATTATTCTAGCAACACAAGGTGCAAGTGGCATGAAGAAAATGATATTCTCTTCTGTGCTTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  TGGCCATGTGGGATTATTCTAGCAACACAAGGTGCAAGTGGCATGAAGAAAATGATATTCTCTTCTGTGCTTTA  720

Query  889  GCTGTTTGCAAGAAGATTGCGTACTGCATCAGTAATTCTCTGGCCACTCTCTTTGGAATCCAGCTCACAGAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GCTGTTTGCAAGAAGATTGCGTACTGCATCAGTAATTCTCTGGCCACTCTCTTTGGAATCCAGCTCACAGAGGC  794

Query  963  TCATGTACCACTACAAGATTATGAGGCCAGCAATAGTGTGACACCCAAAATGGTTGTATTGGATGCAGGGCGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  TCATGTACCACTACAAGATTATGAGGCCAGCAATAGTGTGACACCCAAAATGGTTGTATTGGATGCAGGGCGTT  868

Query 1037  ACCAGAAGCTAAGGGTTGGGAGTTCAGGATTCTCTCATTTCAACTCTTCTAATGAGGAACAAAGATCAAACACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  ACCAGAAGCTAAGGGTTGGGAGTTCAGGATTCTCTCATTTCAACTCTTCTAATGAGGAACAAAGATCAAACACA  942

Query 1111  CCCATTGGTGACTACCCATCTAGGGCAAAAATTTCTGGCCAAAACAGCAGCGTTCGGGGAAGAGGAATTACCCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  CCCATTGGTGACTACCCATCTAGGGCAAAAATTTCTGGCCAAAACAGCAGCGTTCGGGGAAGAGGAATTACCCG  1016

Query 1185  CTTACTAGAGAGCATTTCCAATTCTTCCAGCAATATCCACAAATTCTCCAACTGTGACACTTCACTCTCACCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  CTTACTAGAGAGCATTTCCAATTCTTCCAGCAATATCCACAAATTCTCCAACTGTGACACTTCACTCTCACCTT  1090

Query 1259  ACATGTCCCAAAAAGATGGATACAAATCTTTCTCTTCCTTATCT  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  ACATGTCCCAAAAAGATGGATACAAATCTTTCTCTTCCTTATCT  1134