Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04487
• Subject: XM_017030030.2
• Aligned Length: 1203
• Identities: 976
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGGCACATGTTTCTTCAGAAACTCAAGATGTTTCCCCCAAAGATGAATTAACTGCTTCAGAAGCCTCCACTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCTCCATTGTGTGAACACACCTTCCCTGGGGACTCAGACTTACGGTCAATGATTGAAGAACATGCTTTTCAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTTTGTCACAAGGATCCTTGTTAGAAAGTCCAAGTTACACAGTTTGTGTCTCTGAGCCAGATAAAGATGATGAT  222
                                                         .||.|..||||.||               
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGGCATTGAGACA---------------  14

Query  223  TTTCTTTCTCTGAACTTTCCCAGGAAACTTTGGAAAATAGTGGAAAGTGACCAATTCAAGTCTATTTCATGGGA  296
                    ||||   .|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   15  --------TCTG---GTGGCCAGGAAACTTTGGAAAATAGTGGAAAGTGACCAATTCAAGTCTATTTCATGGGA  77

Query  297  TGAGAATGGAACTTGCATAGTGATTAATGAAGAACTCTTCAAGAAAGAAATTTTGGAAACAAAGGCTCCTTACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  TGAGAATGGAACTTGCATAGTGATTAATGAAGAACTCTTCAAGAAAGAAATTTTGGAAACAAAGGCTCCTTACA  151

Query  371  GAATATTTCAAACTGATGCTATCAAAAGTTTTGTTCGACAGCTCAACCTTTATGGATTTAGTAAAATTCAACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  152  GAATATTTCAAACTGATGCTATCAAAAGTTTTGTTCGACAGCTCAACCTTTATGGATTTAGTAAAATTCAACAG  225

Query  445  AATTTTCAAAGATCTGCCTTTCTAGCCACCTTTCTGTCAGAAGAGAAAGAATCGTCTGTCTTAAGCAAGTTAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  AATTTTCAAAGATCTGCCTTTCTAGCCACCTTTCTGTCAGAAGAGAAAGAATCGTCTGTCTTAAGCAAGTTAAA  299

Query  519  GTTCTATTATAATCCAAATTTCAAGCGTGGCTATCCCCAACTTTTAGTAAGAGTGAAGAGAAGAATTGGTGTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  GTTCTATTATAATCCAAATTTCAAGCGTGGCTATCCCCAACTTTTAGTAAGAGTGAAGAGAAGAATTGGTGTTA  373

Query  593  AAAATGCTTCACCTATATCTACTTTATTCAACGAAGATTTCAACAAGAAGCATTTTAGAGCAGGGGCTAACATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  AAAATGCTTCACCTATATCTACTTTATTCAACGAAGATTTCAACAAGAAGCATTTTAGAGCAGGGGCTAACATG  447

Query  667  GAGAATCATAATTCTGCCTTAGCTGCTGAAGCTAGTGAAGAAAGTTTATTTTCAGCCTCTAAAAATTTAAATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  GAGAATCATAATTCTGCCTTAGCTGCTGAAGCTAGTGAAGAAAGTTTATTTTCAGCCTCTAAAAATTTAAATAT  521

Query  741  GCCTCTAACAAGGGAATCTTCTGTCAGACAGATAATTGCAAATTCATCTGTCCCCATTAGAAGTGGTTTCCCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  GCCTCTAACAAGGGAATCTTCTGTCAGACAGATAATTGCAAATTCATCTGTCCCCATTAGAAGTGGTTTCCCTC  595

Query  815  CTCCTTCACCTTCAACCTCAGTTGGACCATCAGAACAAATTGCAACAGATCAACATGCTATTTTAAATCAGTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  596  CTCCTTCACCTTCAACCTCAGTTGGACCATCAGAACAAATTGCAACAGATCAACATGCTATTTTAAATCAGTTG  669

Query  889  ACCACTATTCATATGCACTCTCATAGTACCTACATGCAAGCAAGGGGCCACATTGTGAATTTTATTACAACCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  ACCACTATTCATATGCACTCTCATAGTACCTACATGCAAGCAAGGGGCCACATTGTGAATTTTATTACAACCAC  743

Query  963  AACTTCTCAATACCACATCATATCTCCCTTACAAAATGGTTATTTTGGGCTGACAGTGGAACCATCTGCTGTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  AACTTCTCAATACCACATCATATCTCCCTTACAAAATGGTTATTTTGGGCTGACAGTGGAACCATCTGCTGTTC  817

Query 1037  CCACACGATATCCTCTGGTATCAGTCAATGAGGCTCCATATCGTAACATGCTACCAGCAGGCAACCCGTGGTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  CCACACGATATCCTCTGGTATCAGTCAATGAGGCTCCATATCGTAACATGCTACCAGCAGGCAACCCGTGGTTG  891

Query 1111  CAAATGCCTACGATCGCTGATAGATCAGCTGCCCCTCATTCCAGGCTAGCTCTTCAACCATCACCACTGGACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  CAAATGCCTACGATCGCTGATAGATCAGCTGCCCCTCATTCCAGGCTAGCTCTTCAACCATCACCACTGGACAA  965

Query 1185  ATATCACCCTAATTACAAC  1203
            |||||||||||||||||||
Sbjct  966  ATATCACCCTAATTACAAC  984