Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04510
- Subject:
- XM_011513293.2
- Aligned Length:
- 1844
- Identities:
- 1699
- Gaps:
- 142
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGGAC---- 6
| ||||
Sbjct 1 ATGGGCCTTGTAAAGAGACTTAACAAATGTACTGAATGTCCACTTTGGGCCAGGCTGGGCACCGA-GGACACAG 73
Query 7 --GACGACTATGAAGCGTACCACAGTCTGTTCTTGTCGCTG-----CTC------------------------- 48
|| ||||.|| ||||||| ||.|||.||| |||
Sbjct 74 GGGA--ACTAAGA-------CACAGTC----CTGGTCACTGGGAAACTCACAGGCTGTTGGGAAAGAAAGATGC 134
Query 49 ----------------------------GGACTCTGCCCGTCTAAGACTCCCATCAATGAAAATGCTCCCGTCT 94
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135 AGAAAGTATCTTCATTTCAGAAAAATATGGACTCTGCCCGTCTAAGACTCCCATCAATGAAAATGCTCCCGTCT 208
Query 95 TTGATCCTGAACCGGTCATTGCCCACTGCTTCAAGCAGTTCCAGCAGAAGGACTTCCGCCTGCCTCAGACCCGC 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209 TTGATCCTGAACCGGTCATTGCCCACTGCTTCAAGCAGTTCCAGCAGAAGGACTTCCGCCTGCCTCAGACCCGC 282
Query 169 CGGCGAATCATCATGGTGCCTCGCAAGGAGGATCAGACACCCCTTAATCCTGCATCCCAACCTCAGGCTCCCCC 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 CGGCGAATCATCATGGTGCCTCGCAAGGAGGATCAGACACCCCTTAATCCTGCATCCCAACCTCAGGCTCCCCC 356
Query 243 AAAGCCCATCCCCAGCTTCAAAGTTCTGGAAGCTAGAGATATCCAAGAGCAGCCAGAGGACAGGAAGACCTGGC 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 AAAGCCCATCCCCAGCTTCAAAGTTCTGGAAGCTAGAGATATCCAAGAGCAGCCAGAGGACAGGAAGACCTGGC 430
Query 317 TGAGCCAGAGGTCGAAGCTGCGGCAGGAGCTAGAGTCCTTTGGTGATGTAAAGAGGTGGCTGGAGAACAAGCCC 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 TGAGCCAGAGGTCGAAGCTGCGGCAGGAGCTAGAGTCCTTTGGTGATGTAAAGAGGTGGCTGGAGAACAAGCCC 504
Query 391 AGCATCACGCCTTCAGAGGCCAAGGTCTTACACATGATCCACGAGGAGCAGAGTGCCCAGCCAAATGCCTCCCA 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 AGCATCACGCCTTCAGAGGCCAAGGTCTTACACATGATCCACGAGGAGCAGAGTGCCCAGCCAAATGCCTCCCA 578
Query 465 GGCAACTACCAGGACCACCAGGAAGAAAGCCCCCAGGCTCTCCCGGCTGTCCCGCCAGATGGTGCCCCAGCTCC 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 GGCAACTACCAGGACCACCAGGAAGAAAGCCCCCAGGCTCTCCCGGCTGTCCCGCCAGATGGTGCCCCAGCTCC 652
Query 539 AGCTGCCCGAGCCCCCTGCCCTGTCGGTCATGTACTCCTACCTGCATAGCCGCAAGATCAAGATCCTGGAGATA 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 AGCTGCCCGAGCCCCCTGCCCTGTCGGTCATGTACTCCTACCTGCATAGCCGCAAGATCAAGATCCTGGAGATA 726
Query 613 TTTCACAAGGTGGGCCAGGGTGAGAACCAGAGAATCACCAGGGAGGAGTTCATCGCGGCTGTAAAGGCAGTCGG 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 TTTCACAAGGTGGGCCAGGGTGAGAACCAGAGAATCACCAGGGAGGAGTTCATCGCGGCTGTAAAGGCAGTCGG 800
Query 687 AGTCCCTCTGAAGAACCAAGAGGTGGAGGATATAGTGATCTACCTCAGCTCTCTTGGGAAGCACAACACCATCA 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 AGTCCCTCTGAAGAACCAAGAGGTGGAGGATATAGTGATCTACCTCAGCTCTCTTGGGAAGCACAACACCATCA 874
Query 761 CCATGGATATCCTGGCCAATACCTACAAGCAGTGGTCTATGGCTCAGCAAAGGAGCAGCCTGGCCACTGCAAGG 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 CCATGGATATCCTGGCCAATACCTACAAGCAGTGGTCTATGGCTCAGCAAAGGAGCAGCCTGGCCACTGCAAGG 948
Query 835 GAGCATTATATCTTGGCCAAGCACAGAGATTCCCTGAAGGGTCCGCTCAAGAAGCAGGAGGTGGATTCAGCCCC 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 GAGCATTATATCTTGGCCAAGCACAGAGATTCCCTGAAGGGTCCGCTCAAGAAGCAGGAGGTGGATTCAGCCCC 1022
Query 909 ACAGCTTCCCAAAGTGGACCTACTGACGGTGCCTGCAGTCGACACGCAGATGGAGACGCGGCCCATGACCCTGG 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 ACAGCTTCCCAAAGTGGACCTACTGACGGTGCCTGCAGTCGACACGCAGATGGAGACGCGGCCCATGACCCTGG 1096
Query 983 AGGAGATGGAGGAAGTGGGCAAGCGGTACCGCGAGCGGCAGCGACAGCACAAGCTCACGATCCCCTCCATCCAG 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 AGGAGATGGAGGAAGTGGGCAAGCGGTACCGCGAGCGGCAGCGACAGCACAAGCTCACGATCCCCTCCATCCAG 1170
Query 1057 TACACGGAGCAATGTCACCTGGTGCGCTGTGGGAATCGGCACTTTGATGAGCACTGCCTCCCGTCCACCATCCA 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 TACACGGAGCAATGTCACCTGGTGCGCTGTGGGAATCGGCACTTTGATGAGCACTGCCTCCCGTCCACCATCCA 1244
Query 1131 CGGGGATATGAGGGAGCTCATTGACTCGGCCCGCAGGCACAACTTTCTGGTCTACCTGCAATGCTGGAAGCTCT 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 CGGGGATATGAGGGAGCTCATTGACTCGGCCCGCAGGCACAACTTTCTGGTCTACCTGCAATGCTGGAAGCTCT 1318
Query 1205 GTAAGTCCTATGGCCTCCCGCTGACAGAGGACATCCTCATGAAAGCCTTGCTGTACCCAGGAGACAAGATCATT 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 GTAAGTCCTATGGCCTCCCGCTGACAGAGGACATCCTCATGAAAGCCTTGCTGTACCCAGGAGACAAGATCATT 1392
Query 1279 TTCCAGATGGACAAAGTGTGCCCCATCCGGCAGCCGGGAGGCTACTACTCTGACTGGAAGGTCTTTTCTCCGAA 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TTCCAGATGGACAAAGTGTGCCCCATCCGGCAGCCGGGAGGCTACTACTCTGACTGGAAGGTCTTTTCTCCGAA 1466
Query 1353 TCTGGCTCTGCTCCGGTCCCAGGGCCCTGGCAAGTCTAAGAGGACTGACAAGAAAACGCCAAAGAAAAGCAAGA 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467 TCTGGCTCTGCTCCGGTCCCAGGGCCCTGGCAAGTCTAAGAGGACTGACAAGAAAACGCCAAAGAAAAGCAAGA 1540
Query 1427 AAATGCGCTTTAAGGAGTTTGAGGAATTTACCAGGAAGCTGAAGGTGAAGAGGTCCAGTGGTCTGCAGCAAACA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 AAATGCGCTTTAAGGAGTTTGAGGAATTTACCAGGAAGCTGAAGGTGAAGAGGTCCAGTGGTCTGCAGCAAACA 1614
Query 1501 CACCCCAATTCCTTCTGGCCGGGTCATCTTCTGGATAAGCTGCAGCTCTACCTGCCCACTGTGGCCACAGACCG 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 CACCCCAATTCCTTCTGGCCGGGTCATCTTCTGGATAAGCTGCAGCTCTACCTGCCCACTGTGGCCACAGACCG 1688
Query 1575 GAGCCTGGCGCTCTTCAGTTGTGTTCAACACCAGCCCCATGTCTACCCAGCCACCTACCACCCTGACCACTGGT 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 GAGCCTGGCGCTCTTCAGTTGTGTTCAACACCAGCCCCATGTCTACCCAGCCACCTACCACCCTGACCACTGGT 1762
Query 1649 GGCCCCTTAGGAACAAGAACTACATGACCCACGCCCATTATGATGCCGCCAAGGTGTACTACATCAAC 1716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 GGCCCCTTAGGAACAAGAACTACATGACCCACGCCCATTATGATGCCGCCAAGGTGTACTACATCAAC 1830