Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04659
- Subject:
- XM_011246395.2
- Aligned Length:
- 1932
- Identities:
- 1497
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTAACAGCCACCCTCTTCGCCCCTTTACTGCAGTGGGGGAAATCGATCATGTGCACATTTTGTCTGAGCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TATTGGTGCCTTGTTGATTGGTGAAGAATATGGTGATGTCACGTTTGTTGTGGAAAAGAAGCACTTTCCTGCCC 148
Query 1 --------------------ATGTGC---------AGAGCATTATTATATGGTGGAATGCGAGAGTCTCAGCCT 45
|.|||| .||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 149 ACAGGGTAATTTTAGCAGCGAGGTGCCAATATTTTCGAGCATTACTGTATGGCGGGATGCGAGAGTCGCAGCCC 222
Query 46 GAAGCAGAAATTCCTCTCCAAGACACCACTGCAGAAGCATTCACAATGCTACTCAAATATATCTACACTGGGCG 119
||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 223 GAAGCAGAGATCCCTCTCCAAGACACCACGGCCGAGGCTTTCACGATGCTCCTCAGATATATCTACACGGGGCG 296
Query 120 GGCAACGCTGACAGATGAGAAGGAGGAGGTGCTGCTGGACTTTTTGAGCCTGGCTCATAAATATGGATTTCCAG 193
|||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 GGCGACGCTCACTGATGAGAAGGAGGAGGTGCTGCTGGACTTCCTGAGCCTGGCTCACAAATACGGATTTCCAG 370
Query 194 AGCTAGAGGATTCTACCTCTGAGTATCTCTGCACCATACTTAACATTCAGAATGTCTGCATGACTTTTGATGTT 267
||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 AGCTGGAGGACTCTACTTCTGAGTATCTCTGCACCATACTGAACATTCAGAATGTCTGTATGACCTTTGATGTT 444
Query 268 GCCAGTCTCTACTCACTTCCCAAGTTAACTTGTATGTGCTGCATGTTTATGGATAGGAATGCTCAGGAAGTCCT 341
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 445 GCCAGTCTCTACTCGCTTCCCAAGTTAACTTGTATGTGCTGCATGTTCATGGACAGAAATGCTCAGGAGGTGCT 518
Query 342 CTCAAGTGAAGGTTTCCTCTCCCTTTCTAAGACAGCACTTTTAAACATCGTGTTAAGAGACTCATTTGCAGCTC 415
..|.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 519 GGCCAGCGACGGCTTCCTCTCCCTGTCCAAGACAGCACTCCTGAATATCGTCTTAAGAGATTCGTTTGCTGCTC 592
Query 416 CCGAAAAAGATATTTTCCTAGCCTTATTAAACTGGTGTAAGCACAATTCAAAGGAGAATCATGCTGAAATCATG 489
|.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGAGAAAGATATTTTCTTAGCCTTGTTAAACTGGTGTAAGCACAATGCAAAAGAGAATCATGCTGAAATCATG 666
Query 490 CAGGCTGTGCGTTTACCTCTCATGAGCCTCACAGAGCTTCTGAATGTTGTGAGGCCTTCAGGACTGCTGTCTCC 563
|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||
Sbjct 667 CAGGCTGTGCGCTTACCTCTAATGAGCCTCACTGAGCTTCTGAACGTCGTGAGGCCATCAGGACTCTTGTCTCC 740
Query 564 TGATGCCATCCTGGATGCCATTAAAGTGCGATCTGAGAGCCGGGATATGGACCTCAATTATAGAGGCATGCTCA 637
.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 741 GGATGCTATTCTTGATGCCATCAAAGTGCGGTCGGAGAGCCGGGATATGGACCTCAACTACAGAGGCATGCTCA 814
Query 638 TACCAGAAGAAAACATTGCAACTATGAAGTATGGAGCCCAAGTTGTAAAGGGGGAGCTGAAATCAGCCTTATTA 711
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||..|.
Sbjct 815 TACCTGAAGAAAACATTGCAACTATGAAGTATGGGGCTCAGGTTGTGAAAGGAGAGCTGAAGTCGGCCTTGCTG 888
Query 712 GATGGTGATACTCAAAATTATGATTTGGATCATGGATTTTCAAGGCACCCAATTGATGATGACTGCCGTTCCGG 785
||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 GATGGTGACACTCAAAACTATGACTTGGATCATGGATTTTCCCGGCACCCCATTGATGATGACTGCCGCTCTGG 962
Query 786 CATCGAGATTAAGCTAGGTCAGCCATCCATTATCAATCACATACGGATACTCTTGTGGGACCGAGATAGCCGGT 859
|||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||..|||||.||||||||||.||.|||||||
Sbjct 963 CATTGAGATCAAGCTTGGCCAGCCGTCCATTATAAACCACATACGTCTACTCCTGTGGGACCGTGACAGCCGGT 1036
Query 860 CTTACTCATACTTCATTGAAGTGTCAATGGATGAACTTGATTGGGTCAGAGTGATAGATCATTCACAATATCTG 933
||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1037 CTTATTCCTACTTTATTGAAGTGTCCATGGACGAACTTGATTGGATCAGAGTGATCGATCACTCACATTACCTG 1110
Query 934 TGTCGTTCTTGGCAGAAATTATATTTTCCAGCCCGTGTCTGCAGTGGAGATGGA-GTCTCACTATGGTGCCCAC 1006
|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||| ||| .|||..|.|.|.|||
Sbjct 1111 TGTCGGTCTTGGCAAAAGTTGTATTTCCCAGCCCGTGTCTGCAG-------GGACCTCTTGCCAGGATGC---- 1173
Query 1007 TCTGGTCTCG--AACTCCTGAGCTCAAG----CAATCCTCCCTCCTTGGCCTTCCAAAGTG--CAGGTATATTC 1072
||.|.| ||.|| .||..|||| |||..|| ||||.| .||||||||.|
Sbjct 1174 ----GTGTGGGAAAATC--AAGGACAAGGACACAAAGCT----------------AAAGAGATAAGGTATATCC 1225
Query 1073 GAATTGTTGGGACTCACAACACAGTGAACAAGATTTTTCACATTGTGGCTTTTGAATGTATGTTTACAAACAAA 1146
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1226 GAATAGTTGGGACTCACAACACAGTGAACAAGATTTTCCACATTGTGGCTTTTGAATGCATGTTTACAAACAAA 1299
Query 1147 ACCTTCACTCTTGAGAAGGGGCTGATAGTTCCCATGGAGAATGTTGCAACAATTGCTGATTGTGCCAGTGTGAT 1220
.|||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1300 GCCTTCACCCTGGAGAAGGGCCTGATAGTTCCCCTGGAGAATGTGGCAACGATCGCAGATTGTGCCAGTGTGAT 1373
Query 1221 TGAAGGAGTCAGTCGGAGCCGAAATGCCTTGCTGAATGGGGACACTAAGAATTATGACTGGGATTCTGGCTACA 1294
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1374 TGAAGGAGTCAGTCGGAGCCGGAATGCCTTGCTGAATGGGGACACTAAGAATTATGACTGGGACTCTGGCTACA 1447
Query 1295 CATGTCACCAGCTAGGAAGTGGTGCGATTGTGGTTCAGTTGGCACAACCGTACATGATTGGGTCAATACGGTTA 1368
|.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1448 CGTGCCACCAGCTGGGCAGTGGTGCCATTGTGGTTCAGCTGGCACAGCCATACATAATTGGCTCAATACGGTTA 1521
Query 1369 CTACTTTGGGATTGTGATGATCGAAGCTATAGCTACTACGTTGAGGTTTCTACCAACCAGCAACAGTGGACCAT 1442
.||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1522 TTACTCTGGGACTGCGATGATCGAAGCTACAGCTACTATGTTGAGGTTTCCACCAATCAGCAGCAGTGGACCAT 1595
Query 1443 GGTTGCTGACAGAACTAAAGTCTCCTGCAAGTCCTGGCAGTCAGTAACTTTTGAAAGGCAGCCTGCCTCCTTCA 1516
|||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1596 GGTGGCCGACAGAACGAAAGTGTCCTGCAAGTCCTGGCAGTCAGTCACTTTTGAAAGACAGCCTGCATCCTTCA 1669
Query 1517 TCCGTATCGTTGGGACACACAACACAGCAAATGAGGTGTTCCACTGTGTCCACTTTGAGTGTCCAGAGCAGCAG 1590
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1670 TCCGAATCGTCGGGACACACAACACAGCAAATGAGGTGTTCCACTGTGTCCACTTTGAGTGTCCGGAGCAGCAG 1743
Query 1591 AGCAGCCAGAAGGAGGAAAATAGTGAGGAATCGGGGACAGGGGACACCAGCCTGGCCGGTCAGCAGCTCGACTC 1664
||||.||||||||||||.|..||||||||..|.||||||||||||.|||||....||..|||||||||||||.|
Sbjct 1744 AGCAACCAGAAGGAGGACAGCAGTGAGGAGCCAGGGACAGGGGACCCCAGCACCCCCAATCAGCAGCTCGACCC 1817
Query 1665 CCATGCGCTGCGGGCGCCTAGTGGCAGCTCACTACCCTCCAGCCCAGGCTCCAACTCACGCTCCCCCAACCGGC 1738
.|||||.|..|||||.||.||.|.||||||||||||..|.||.||||||.|.|||||||||||.|||||||..|
Sbjct 1818 TCATGCACCACGGGCACCCAGCGCCAGCTCACTACCACCGAGTCCAGGCCCTAACTCACGCTCACCCAACCAAC 1891
Query 1739 AGCACCAA 1746
||.|||||
Sbjct 1892 AGAACCAA 1899