Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04688
• Subject: XM_006519064.1
• Aligned Length: 1200
• Identities: 861
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCATCAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222
                                                         ||||||||||||                 
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGCAATGCCTT-----------------  12

Query  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGA  296
                                                                     ||||||||.|||||.||
Sbjct   13  ---------------------------------------------------------GAGTTTATTTTGTCTGA  29

Query  297  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  370
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct   30  AGATTATAACAAGATGACACCTGTGAAAAACTATCAAGCACATCAGAGCAGAGTAACGATGGTCCTGTTTGTTC  103

Query  371  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  444
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  104  TGGAACTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAGTTCGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGACAGCGC  177

Query  445  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  518
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  178  CTGGGAGGTTACCGCACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGTCATGTGTTTATTGG  251

Query  519  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  592
            .||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||.|.||||||||.|
Sbjct  252  CGATCACTCGGGCCAAGTAACCATCCTCAAACTGGAACAAGAAAACTGCACACTGCTCACATCCTTCAGAGGGC  325

Query  593  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  666
            |||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  326  ACACAGGAGGGGTGACAGCACTCTGCTGGGACCCGGTGCAGCGCGTGCTATTCTCAGGCAGTTCCGATCACTCT  399

Query  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  400  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGCACGGCCATCGAACTCCAAGGACACAATGACAAAGTCCAGGC  473

Query  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  814
            |||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  474  CCTCTCCTATGCACAGCACACACGACAGCTCATCTCATGTGGCGGTGACGGTGGCATTGTCGTCTGGAACATGG  547

Query  815  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  888
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  548  ATGTGGAAAGGCAGGAGACCCCTGAGTGGTTGGACAGTGACTCCTGCCAAAAGTGTGACCAGCCTTTCTTCTGG  621

Query  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  622  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGACTAAGACAGCACCACTGCCGGAAGTGTGGGAAGGCCGT  695

Query  963  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  1036
            .||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  696  GTGCGGCAAGTGTAGCTCCAAGCGCTCTTCCATCCCACTCATGGGCTTTGAGTTTGAAGTGCGGGTCTGCGACA  769

Query 1037  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  770  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGCGCCCCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAGCATAACATTGTG  843

Query 1111  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATAT  1184
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct  844  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGGGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTAATTAAGCTGTGGGACAT  917

Query 1185  GACCCCAGTCGTGTCT  1200
            |||||||||.|||||.
Sbjct  918  GACCCCAGTGGTGTCA  933