Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04688
• Subject: XM_011534914.1
• Aligned Length: 1208
• Identities: 1183
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGA  74

Query   75  GGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCATCAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCATCAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTG  148

Query  149  TTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222

Query  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGA  296

Query  297  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  370

Query  371  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  444

Query  445  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  518

Query  519  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  592

Query  593  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  666

Query  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  740

Query  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  814

Query  815  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  888

Query  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  962

Query  963  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  1036

Query 1037  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  1110

Query 1111  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATAT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1111  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAG-----------  1173

Query 1185  GACC-------CCAGTC-GTGTCT  1200
              ||       |||.|| |.|.| 
Sbjct 1174  --CCCACAGAGCCACTCAGAGGC-  1194