Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04688
- Subject:
- XR_001781124.1
- Aligned Length:
- 1393
- Identities:
- 1066
- Gaps:
- 242
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGGCCCGCTCCGCTTCGCAGCCCGATCCTGAGCGCAAGCCTGAGCGTTCTCTTCAGCCAAGTCCCCCGGCGCGT 74
Query 1 -----------------------------ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATC 45
|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGGCTGCTCCCCGGGCGCGCCCCCTCCGATGGCGGCGGAGATCCAGCCCCAGCCACTGACCCGCAAGCCGATC 148
Query 46 CTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGAGGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCAT 119
||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 149 CTGCTGCAGCGGGTCGAGGGGTCGCAGGAGGTGGTCAACATGGCGGTGATTGTACCTAAAGAAGAGGGTGTCAT 222
Query 120 CAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTGTTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACC 193
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 223 CAGCGTCTCGGAGGACAGGACAGTTCGTGTTTGGTTAAAGAGGGACAGTGGACAGTACTGGCCAAGCATCTACC 296
Query 194 ATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATGTCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAAT 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATGTCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAAT 370
Query 268 GGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGAAGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCA 341
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 371 GGTACAATCTCAGAGTTTATTTTGTCTGAAGATTATAACAAGATGACACCTGTGAAAAACTATCAAGCACATCA 444
Query 342 GAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCCTGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTG 415
|||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 445 GAGCAGAGTAACGATGGTCCTGTTTGTTCTGGAACTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAGTTCG 518
Query 416 CCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGCCTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTT 489
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGACAGCGCCTGGGAGGTTACCGCACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTT 592
Query 490 GATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGGTGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAA 563
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 593 GATGTTGAAACCCGTCATGTGTTTATTGGCGATCACTCGGGCCAAGTAACCATCCTCAAACTGGAACAAGAAAA 666
Query 564 CTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGACACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGG 637
||||||.|||.|||||.|.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 667 CTGCACACTGCTCACATCCTTCAGAGGGCACACAGGAGGGGTGACAGCACTCTGCTGGGACCCGGTGCAGCGCG 740
Query 638 TGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCTGTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAG 711
||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 741 TGCTATTCTCAGGCAGTTCCGATCACTCTGTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGCACGGCCATCGAA 814
Query 712 CTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGCCCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGG 785
||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 815 CTCCAAGGACACAATGACAAAGTCCAGGCCCTCTCCTATGCACAGCACACACGACAGCTCATCTCATGTGGCGG 888
Query 786 TGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGGACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCT 859
|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 889 TGACGGTGGCATTGTCGTCTGGAACATGGATGTGGAAAGGCAGGAGACCCCTGAGTGGTTGGACAGTGACTCCT 962
Query 860 GCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGGAACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAG 933
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 963 GCCAAAAGTGTGACCAGCCTTTCTTCTGGAACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGACTAAGACAG 1036
Query 934 CACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGTCTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGG 1007
|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1037 CACCACTGCCGGAAGTGTGGGAAGGCCGTGTGCGGCAAGTGTAGCTCCAAGCGCTCTTCCATCCCACTCATGGG 1110
Query 1008 CTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACAGCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGA----------------- 1064
|||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTTGAGTTTGAAGTGCGGGTCTGCGACAGCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAGTAAGTCCCACGCCCTG 1184
Query 1065 -------------------------------------------------------------------------A 1065
|
Sbjct 1185 CACCCTCCGGGTTATGGACAAAGCCCAGCCTGAGAATTCCTCCAGAGAAATTCCACCTGCCTGGCTTGCTGGGA 1258
Query 1066 CGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTGCATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATG 1139
||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1259 CGCGCCCCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAGCATAACATTGTGCATGTGCATTTCGATGCAACCAGGGGATG 1332
Query 1140 GTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATATGACCCCAGTCGTGTCT 1200
||||||||||||
Sbjct 1333 GTTACTGACTTC------------------------------------------------- 1344