Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04689
Subject:
NM_001256099.2
Aligned Length:
739
Identities:
647
Gaps:
62

Alignment

Query   1  ATGCGACC-CCAGGGCCCCGCCGCCTCCCCG-CAGCGGCTCCG--------CGGCCTCCTGCTGCTCCTGCTGC  64
           |||.|.|| |||||   ..|..||.||.|.| ||  .|||.||        |.|..|||.|        |...|
Sbjct   1  ATGTGGCCGCCAGG---TAGGAGCATCACAGTCA--AGCTACGGGAGAAAACAGTTTCCAG--------GAAAC  61

Query  65  TGCAGCTGCCCGCGCCGTCGAGCGCCTCTGAGATCCCCAAGGGGAAGCAAAAGGCGCAGCTCCGGCAGAGGGAG  138
           ||.|..||..|| |||  ||||.||.|      |||   |||          |||.||.||      |.|||| 
Sbjct  62  TGGAAATGAACG-GCC--CGAGTGCTT------TCC---AGG----------GGCTCATCT------GTGGGA-  106

Query 139  GTGGTGGACCTGTATAATGGAATGTGCTTACAAGGGCCAGCAGGAGTGCCTGGTCGAGACGGGAGCCCTGGGGC  212
                     .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107  ----------AGTATAATGGAATGTGCTTACAAGGGCCAGCAGGAGTGCCTGGTCGAGACGGGAGCCCTGGGGC  170

Query 213  CAATGGCATTCCGGGTACACCTGGGATCCCAGGTCGGGATGGATTCAAAGGAGAAAAGGGGGAATGTCTGAGGG  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171  CAATGGCATTCCGGGTACACCTGGGATCCCAGGTCGGGATGGATTCAAAGGAGAAAAGGGGGAATGTCTGAGGG  244

Query 287  AAAGCTTTGAGGAGTCCTGGACACCCAACTACAAGCAGTGTTCATGGAGTTCATTGAATTATGGCATAGATCTT  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245  AAAGCTTTGAGGAGTCCTGGACACCCAACTACAAGCAGTGTTCATGGAGTTCATTGAATTATGGCATAGATCTT  318

Query 361  GGGAAAATTGCGGAGTGTACATTTACAAAGATGCGTTCAAATAGTGCTCTAAGAGTTTTGTTCAGTGGCTCACT  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319  GGGAAAATTGCGGAGTGTACATTTACAAAGATGCGTTCAAATAGTGCTCTAAGAGTTTTGTTCAGTGGCTCACT  392

Query 435  TCGGCTAAAATGCAGAAATGCATGCTGTCAGCGTTGGTATTTCACATTCAATGGAGCTGAATGTTCAGGACCTC  508
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393  TCGGCTAAAATGCAGAAATGCATGCTGTCAGCGTTGGTATTTCACATTCAATGGAGCTGAATGTTCAGGACCTC  466

Query 509  TTCCCATTGAAGCTATAATTTATTTGGACCAAGGAAGCCCTGAAATGAATTCAACAATTAATATTCATCGCACT  582
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467  TTCCCATTGAAGCTATAATTTATTTGGACCAAGGAAGCCCTGAAATGAATTCAACAATTAATATTCATCGCACT  540

Query 583  TCTTCTGTGGAAGGACTTTGTGAAGGAATTGGTGCTGGATTAGTGGATGTTGCTATCTGGGTTGGCACTTGTTC  656
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 541  TCTTCTGTGGAAGGACTTTGTGAAGGAATTGGTGCTGGATTAGTGGATGTTGCTATCTGGGTTGGTACTTGTTC  614

Query 657  AGATTACCCAAAAGGAGATGCTTCTACTGGATGGAATTCAGTTTCTCGCATCATTATTGAAGAACTACCAAAA  729
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615  AGATTACCCAAAAGGAGATGCTTCTACTGGATGGAATTCAGTTTCTCGCATCATTATTGAAGAACTACCAAAA  687