Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04697
Subject:
NM_001177789.1
Aligned Length:
566
Identities:
467
Gaps:
19

Alignment

Query   1  MAASEDGSGCLVSRGRSQSDP-------SVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSK  67
                       .||......       |.|...........|...||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct   1  ------------MRGQGRGHARWPAPLRSLLRAFGPQDTTTGGLEQDEMDQTPPARSEPLVSGIRTPPVRRNSK  62

Query  68  LATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPT  141
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.|.|..|...||||||.
Sbjct  63  LATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKQGLLEMMEQDSENKACSPKEGSQPVQSEPPA  136

Query 142  PKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLD  215
           ...||||||.||||||.|.||||||.|..|||.|||||.|..||||..||||||||||||.|.||||||.||||
Sbjct 137  GEQETLTSEGAQPGSPSASGTDQVSQDELLSSDAHLDDTANIPSASTAEEADAGSLLPTTDEPSQALAGSDSLD  210

Query 216  SPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLP  289
           ||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||..|||...|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct 211  SPPRSLERSVSQLPSPPLLPTPPPKASSKATKNVTGQAALFQGPSMKNNEPALRGQLATPTGSPHVTTVHRPLP  284

Query 290  PSRVIEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESEENK  363
           ||||.||||||||||||||||||||..||||||.|||||||||.||||||.||||||||.|||.||.|.|||||
Sbjct 285  PSRVMEELHRALATKHRQDSFQGRECRGSPKKRMDVRLSRTSSMERGKERDEAWSFDGASENKWTATKDSEENK  358

Query 364  ENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQI  437
           |||...||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359  ENLMLSSELKDDMLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQI  432

Query 438  EMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQ  511
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 433  EMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVARAQ  506

Query 512  DYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP  559
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507  DYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP  554