Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04697
- Subject:
- NM_001199505.1
- Aligned Length:
- 1702
- Identities:
- 1629
- Gaps:
- 59
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGC-CGCTCGCAGAGTG------ACCCCAGCG 67
|| |||| ||| ||||.||.||||| |||.||| || .||||.|||
Sbjct 1 AT----GCGT--------------GGC-----CGTGGCGGGGGGCGCGCCCGC----TGTCCTGCGCCCCTGCG 47
Query 68 TCCTCAC-------CGACTCCTCGGCC----AC-CT-CCTCCGCGGACGCCGGGGAGAAC-----CCAGATGAG 123
|||.| ||.||.|..|||| || || ||.|||| |||| .||||.| |.|||||||
Sbjct 48 --CTCGCTGCTGGGCGCCTTCGGGGCCCGGGACGCTGCCGCCGC---CGCC--CGAGATCCTGCGCAAGATGAG 114
Query 124 ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG 188
Query 198 CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA 262
Query 272 CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG 336
Query 346 ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC 410
Query 420 CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG 484
Query 494 TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGT 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGT 558
Query 568 GAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCT 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 GAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCT 632
Query 642 GGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCAC 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCAC 706
Query 716 CCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT 780
Query 790 GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT 854
Query 864 TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA 928
Query 938 GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG 1002
Query 1012 GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA 1076
Query 1086 CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG 1150
Query 1160 ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA 1224
Query 1234 AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA 1298
Query 1308 GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA 1372
Query 1382 AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG 1446
Query 1456 AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC 1520
Query 1530 GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG 1594
Query 1604 AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1668