Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04772
- Subject:
- NM_001321676.2
- Aligned Length:
- 1111
- Identities:
- 1055
- Gaps:
- 32
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
Query 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
Query 149 GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA 222
Query 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC 296
Query 297 CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC 370
Query 371 AATTCCTACCTCCAGAGGTTG--------GCGATTTGAA--GGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCG 434
||||||||||||||||...|| || |.|||| ||.|.|.|.|..| |.|||.||..||.||.||
Sbjct 371 AATTCCTACCTCCAGACCATGAGAACATTGC--TCTGAACTGGTGTTCCTGTGA--ACACAGTTGGACTAACCG 440
Query 435 TTTGCTAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTAT 508
.| |||| ||||.| ||||...||| |...||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 CT-----ACTT-----GAGATG-------TGTGTTGTTC-CATAAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTAT 496
Query 509 GGTATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTT 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GGTATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTT 570
Query 583 TTGCCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTT 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 TTGCCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTT 644
Query 657 GCCATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGC 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 GCCATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGC 718
Query 731 TGCTTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGAT 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGCTTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGAT 792
Query 805 CACGTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAA 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CACGTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAA 866
Query 879 CTTTCTGTCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGT 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CTTTCTGTCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGT 940
Query 953 GTAGTGAGCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCAC 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GTAGTGAGCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCAC 1014
Query 1027 CAGTGGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CAGTGGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAG 1088
Query 1101 T 1101
|
Sbjct 1089 T 1089