Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04772
• Subject: XR_001751086.2
• Aligned Length: 1522
• Identities: 1101
• Gaps: 421

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CTCGCCTGGCTCCCTGCCCCGCCCCGCCCGCCGTCCCCCGCTTGGCTTCCAGCGCCGCTTGCGCTCCGGAGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGCTCTGCTGGCGCTGAGAAATGGACCAATTTTGACAAGATATAGTGCTGCAGCGTGCCTGATGGGATATATT  148

Query    1  -----ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAAT  69
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTCATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAAT  222

Query   70  TATAGGAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATAT  143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATAGGAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATAT  296

Query  144  GAAAAGGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGC  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAAGGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGC  370

Query  218  ACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGAC  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGAC  444

Query  292  AATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCA  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCA  518

Query  366  ACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTTGC  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTTGC  592

Query  440  TAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGTAT  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGTAT  666

Query  514  GTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTGCC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTGCC  740

Query  588  ACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCAT  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCAT  814

Query  662  CTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTG-----------------------------------------  694
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  815  CTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGGCTTCTGTACTGCTGCACATGCTGTTCCCTCTGCTTGGAA  888

Query  695  ----------------------------GCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT  740
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTCATAACACATTTCCATTTATTCCAGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT  962

Query  741  TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC  1036

Query  815  CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTTTCTGTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTTTCTGTCT  1110

Query  889  CCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGAGCC  1184

Query  963  TATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGAAGA  1258

Query 1037  CAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT---------  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1259  CAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGTTGATAAACA  1332

Query 1102  --------------------------------------------------------------------------  1101
                                                                                      
Sbjct 1333  CTCAAGAACCTCAGGAGCGCTGCCAGCTTGACACTGGGGAATCCAGCCAGTCCAGCACACTCTTCCATCCTGTC  1406

Query 1102  --------------------------------------------------------------------------  1101
                                                                                      
Sbjct 1407  CTGTCCAATGCGGGGGCACTGCAGAACTCTCTAGAAATGTCATGATTGAGCTTCAGAGCTAAAATGCCTTCACC  1480

Query 1102  ------------------------------------------  1101
                                                      
Sbjct 1481  CTTCCCCCAAGTTGGAATATATCCTCCCCCAAATTAAGGACC  1522