Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04781
- Subject:
- XM_011522866.1
- Aligned Length:
- 1632
- Identities:
- 1504
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCCATTTCATCCTTCCTCCCTGTGGCCTCCACATCTTACAACCCAGCCTGGAGGGAGGGGCCGCGCAGCC 74
Query 1 ----------------------------------------ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGA 34
|.|| ||| |.|||||||||||||
Sbjct 75 CCGAGGGGCCAGGTCTCCCAGGCGGCGTCCACTCCCCTCGAGGG----TGG--------AGGAGGTTGAAAGGA 136
Query 35 TTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAG 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAG 210
Query 109 GACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTC 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 GACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTC 284
Query 183 CAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGG 358
Query 257 TTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAAC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAAC 432
Query 331 CCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGT 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 CCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGT 506
Query 405 GTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 GTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGG 580
Query 479 ACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCAT 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCAT 654
Query 553 GTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCT 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCT 728
Query 627 GACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 GACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACA 802
Query 701 AAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 AAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAA 876
Query 775 GGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGT 950
Query 849 CCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCT 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCT 1024
Query 923 GCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCA 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCA 1098
Query 997 GAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGC 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGC 1172
Query 1071 CCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGC 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 CCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGC 1246
Query 1145 CCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTG 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTG 1320
Query 1219 GCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGT 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGT 1394
Query 1293 CTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGT 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 CTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGT 1468
Query 1367 TAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTC 1542
Query 1441 ATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGA 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 ATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGA 1616
Query 1515 AGTC 1518
||||
Sbjct 1617 AGTC 1620