Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04781
• Subject: XM_011522867.2
• Aligned Length: 1520
• Identities: 1504
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGGGG--ACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAG  72
                   .|||.|  ||||    |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------ATGGAGCCACCT----GGGGTTGAAAGGATTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAG  63

Query   73  TATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAGGACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  TATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAGGACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGA  137

Query  147  GGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  GGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTA  211

Query  221  CCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAG  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  CCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAG  285

Query  295  AGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  AGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAA  359

Query  369  GCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  GCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGC  433

Query  443  CCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAAT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  CCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAAT  507

Query  517  GGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCA  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  GGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCA  581

Query  591  CGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  CGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGA  655

Query  665  GGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAAC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  GGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAAC  729

Query  739  TGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  TGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGA  803

Query  813  TAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCA  877

Query  887  AACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  AACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTG  951

Query  961  TCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  TCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTT  1025

Query 1035  TAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  TAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACA  1099

Query 1109  TCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCC  1173

Query 1183  TCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGC  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  TCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGC  1247

Query 1257  CCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGC  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  CCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGC  1321

Query 1331  GGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAA  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  GGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAA  1395

Query 1405  TCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGA  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  TCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGA  1469

Query 1479  CTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  CTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC  1509