Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04781
- Subject:
- XM_024450151.1
- Aligned Length:
- 1518
- Identities:
- 1341
- Gaps:
- 177
Alignment
Query 1 ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAGGACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACC 45
Query 223 TCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 TCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAG 119
Query 297 CAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGC 193
Query 371 CCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 CCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCC 267
Query 445 CTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 CTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGG 341
Query 519 GTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 GTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACG 415
Query 593 CTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 CTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGG 489
Query 667 AAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 AAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTG 563
Query 741 TCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 TCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATA 637
Query 815 ACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 ACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAA 711
Query 889 CTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 CTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTC 785
Query 963 CAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 CAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTA 859
Query 1037 AGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 AGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATC 933
Query 1111 GTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 934 GTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTC 1007
Query 1185 CTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 CTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCC 1081
Query 1259 AGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 AGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGG 1155
Query 1333 GTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 GTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATC 1229
Query 1407 AGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 AGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACT 1303
Query 1481 CCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 CCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC 1341