Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04787
• Subject: NM_176847.3
• Aligned Length: 1383
• Identities: 1256
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAACGACCAGTACCACCGGGCAGCCCGGGATGGCTACCTGGAGCTCCTCAAGGAGGCCACCCGAAAGGAGCT  74
            |||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGAATGACCAGTATCACCGGGCCGCCAGGGATGGCTATCTGGAACTCCTCAAGGAGGCCACCCGGAAGGAGCT  74

Query   75  GAATGCCCCCGACGAGGATGGCATGACCCCCACTCTCTGGGCTGCCTACCATGGCAACCTCGAGTCGCTGCGTC  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  GAATGCCCCTGACGAGGATGGCATGACCCCGACTCTCTGGGCTGCCTACCATGGCAACCTGGAGTCTCTGCGCC  148

Query  149  TCATTGTGAGCCGCGGGGGTGACCCGGACAAGTGTGACATCTGGGGCAACACACCCCTGCATCTGGCAGCTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATTGTGAGCCGCGGGGGTGACCCGGATAAGTGTGACATCTGGGGAAACACACCCTTGCATCTGGCAGCTTCC  222

Query  223  AATGGCCACTTGCACTGCCTGTCCTTCCTGGTGTCCTTCGGAGCCAACATCTGGTGCCTAGACAACGACTACCA  296
            |||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  AATGGTCACCTGCACTGCCTGTCCTTCCTCGTCTCCTTCGGGGCCAACATCTGGTGCCTGGACAATGACTACCA  296

Query  297  CACGCCGCTGGACATGGCTGCCATGAAGGGCCACATGGAATGCGTGCGCTACCTGGACTCCATCGCGGCCAAGC  370
            ||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CACGCCACTGGACATGGCCGCTATGAAGGGCCACATGGAGTGCGTACGCTATCTGGATTCCATCGCGGCCAAGC  370

Query  371  AGAGCAGCCTCAACCCCAAGCTGGTGGGTAAGCTGAAGGACAAGGCCTTCCGCGAGGCGGAGCGGCGCATCCGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGCAGCCTCAACCCCAAGCTGGTGGGCAAGCTGAAGGACAAGGCCTTCCGCGAGGCAGAGCGGCGCATCCGC  444

Query  445  GAGTGCGCCAAGCTGCAGCGGAGGCACCACGAACGCATGGAGCGGCGATACCGGCGCGAGCTGGCCGAGCGTTC  518
            ||||||||||||.|||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GAGTGCGCCAAGATGCAGCGCAAGCACCACGAGCGCATGGAGCGGCGCTACCGGCGCGAGCTGGCCGAGCGCTC  518

Query  519  CGACACCCTCAGCTTCTCCAGCCTCACGTCCAGCACCCTGAGCCGCCGGCTGCAGCATCTGGCGCTGGGCAGCC  592
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||.||||||||||||
Sbjct  519  CGACACTCTCAGCTTCTCCAGCCTCACGTCCAGCACCCTGAGCCGACGGCTGCAGCACATGACGCTGGGCAGCC  592

Query  593  ACCTGCCGTACTCTCAGGCCACGCTGCACGGCACGGCCAGGGGCAAGACCAAGATGCAGAAGAAGCTGGAGCGG  666
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct  593  AGCTGCCCTACTCGCAGGCCACGCTGCACGGTACGGCCAAGGGCAAGGCCAAGATCCAGAAGAAGCTGGAGAGG  666

Query  667  CGCAAGCAGGGCGGCGAAGGCACCTTCAAGGTCTCCGAGGATGGGCGCAAGAGCGCCCGCTCGCTCTCGGGCCT  740
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.|||||
Sbjct  667  CGCAAGCAGGGGGGCGAGGGCACCTTCAAGGTCTCTGAGGACGGGCGCAAAAGCGTCCGATCGCTCTCCGGCCT  740

Query  741  GCAGCTGGGCAGCGACGTGATGTTCGTGCGCCAGGGCACCTACGCCAATCCCAAGGAGTGGGGCCGAGCCCCGC  814
            ||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  GCAGTTGGGTAGTGATGTGATGTTTGTGCGCCAGGGCACCTACGCCAACCCCAAGGAGTGGGGCCGTGCCCCAC  814

Query  815  TCCGGGACATGTTCCTCTCGGACGAGGACAGCGTCTCCCGTGCCACGCTGGCGGCCGAGCCTGCCCACTCGGAG  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  TCAGGGACATGTTCCTCTCGGACGAGGACAGCGTCTCCCGTGCCACACTGGCTGCCGAGCCTGCTCACTCGGAG  888

Query  889  GTCAGCACCGACTCAGGCCACGACTCCCTGTTTACCCGCCCCGGCCTGGGCACCATGGTGTTCCGCAGAAATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  889  GTCAGCACCGACTCAGGCCACGACTCTTTGTTTACCCGCCCCGGCCTGGGTACCATGGTGTTTCGAAGGAACTA  962

Query  963  CTTGAGCAGTGGGCTGCACGGACTGGGCCGCGAGGATGGGGGTCTGGATGGGGTGGGAGCGCCGCGGGGTCGGC  1036
            ..|||||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.||||||.|||||||||..||..|||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGAGCAGCGGGTTGCACGGGCTGGGCCGAGAGGACGGGGGTTTGGATGGGGCAGGCACGCCGCGGGGTCGGC  1036

Query 1037  TGCAGAGCTCCCCCAGCCTGGACGATGACAGCCTGGGCAGTGCCAACAGCCTGCAGGACCGCAGCTGTGGGGAG  1110
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TGCATAGTTCCCCCAGCCTGGACGACGACAGCCTAGGCAGTGCCAACAGCTTGCAGGACCGCAGTTGCGGGGAA  1110

Query 1111  GAGCTGCCCTGGGATGAGCTCGATTTAGGCTTGGACGAGGACCTGGAGCCCGAGACTAGCCCGCTGGAGACCTT  1184
            ||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1111  GAGCTGCCCTGGGATGAGCTAGACTTGGGCTTGGATGAGGACCTGGAGCCCGAGACCAGCCCCTTGGAGACCTT  1184

Query 1185  CCTGGCCTCTCTGCACATGGAGGACTTTGCCGCCCTCCTGCGGCAGGAGAAGATCGACCTCGAGGCTTTGATGC  1258
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||.||||||
Sbjct 1185  CCTGGCCTCGCTGCACATGGAAGACTTTGCCTCTCTCCTGCGGCACGAGAAGATTGACCTGGAGGCTCTGATGC  1258

Query 1259  TGTGCTCTGACCTCGACCTCCGCAGCATCAGCGTCCCACTGGGGCCCCGAAAGAAGATCTTGGGGGCCGTGAGG  1332
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTGCTCTGACCTGGACCTGCGCAGCATCAGCGTGCCCCTGGGGCCTCGGAAGAAGATCCTGGGGGCCGTGAGG  1332

Query 1333  AGGCGGCGGCAGGCGATGGAGCGCCCGCCGGCCCTGGAGGACACAGAGCTA  1383
            |||||..|||||||..|||||||.||.|.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1333  AGGCGCAGGCAGGCTCTGGAGCGACCCCTGGCCCTGGAGGACACGGAGCTA  1383