Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04817
• Subject: NM_001323909.2
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1230
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC  148

Query  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC  222

Query  223  TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC  296

Query  297  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  370

Query  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  444

Query  445  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  518

Query  519  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  592

Query  593  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACC  666
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  593  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCT-----------------------------------------------  619

Query  667  TCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAA  740
                                                                               |||||||
Sbjct  620  -------------------------------------------------------------------CAGCCAA  626

Query  741  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  700

Query  815  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  774

Query  889  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  848

Query  963  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  922

Query 1037  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  996

Query 1111  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  1070

Query 1185  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  1144

Query 1259  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1218

Query 1333  ACTGTTTCATCT  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1219  ACTGTTTCATCT  1230