Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04817
- Subject:
- XM_017000253.2
- Aligned Length:
- 1392
- Identities:
- 927
- Gaps:
- 462
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT 74
Query 75 GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTG----------------------------------------- 107
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGTTTTCCAAATTGAGAGTCTCCTGTGGATATATAGGTGATA 148
Query 108 -------GCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT 174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTGTAAGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT 222
Query 175 CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA 296
Query 249 TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT 370
Query 323 TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT 444
Query 397 TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA 518
Query 471 GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG 592
Query 545 CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC 666
Query 619 TCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACCTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCT 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACCTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCT 740
Query 693 TGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT 814
Query 767 CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC 888
Query 841 CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG 962
Query 915 ACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGTAATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGT 988
|||||||| |..||.||
Sbjct 963 ACAGCAAG--------------GAAGGCAA-------------------------------------------- 978
Query 989 TGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGA 1062
Sbjct 979 -------------------------------------------------------------------------- 978
Query 1063 GAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGA 1136
Sbjct 979 -------------------------------------------------------------------------- 978
Query 1137 GCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACAGCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCA 1210
Sbjct 979 -------------------------------------------------------------------------- 978
Query 1211 TGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTG 1284
Sbjct 979 -------------------------------------------------------------------------- 978
Query 1285 ACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT 1344
Sbjct 979 ------------------------------------------------------------ 978