Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04821
Subject:
XM_017000272.1
Aligned Length:
711
Identities:
548
Gaps:
162

Alignment

Query   1  ATGGCGGCTGCGTCGGGGTCGGTTCTGCAGCGCTGTATCGTGTCGCCGGCAGGGAGGCATAGCGCCTCTCTGAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CTTCCTGCATGGCTCAGGTGATTCTGGACAAGGATTAAGAATGTGGATCAAGCAGGTTTTAAATCAAGATTTAA  148
                                                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------------------ATGTGGATCAAGCAGGTTTTAAATCAAGATTTAA  34

Query 149  CATTCCAACACATAAAAATTATTTATCCAACAGCTCCTCCCAGATCATATACTCCTATGAAAGGAGGAATCTCC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  35  CATTCCAACACATAAAAATTATTTATCCAACAGCTCCTCC----------------------------------  74

Query 223  AATGTATGGTTTGACAGATTTAAAATAACCAATGACTGCCCAGAACACCTTGAATCAATTGATGTCATGTGTCA  296
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  --------------CAGATTTAAAATAACCAATGACTGCCCAGAACACCTTGAATCAATTGATGTCATGTGTCA  134

Query 297  AGTGCTTACTGATTTGATTGATGAAGAAGTAAAAAGTGGCATCAAGAAGAACAGGATATTAATAGGAGGATTCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135  AGTGCTTACTGATTTGATTGATGAAGAAGTAAAAAGTGGCATCAAGAAGAACAGGATATTAATAGGAGGATTCT  208

Query 371  CTATGGGAGGATGCATGGCAATGCATTTAGCATATAGAAATCATCAAGATGTGGCAGGAGTATTTGCTCTTTCT  444
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209  CTATGGGAGGATGCATGGCAATACATTTAGCATATAGAAATCATCAAGATGTGGCAGGAGTATTTGCTCTTTCT  282

Query 445  AGTTTTCTGAATAAAGCATCTGCTGTTTACCAGGCTCTTCAGAAGAGTAATGGTGTACTTCCTGAATTATTTCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283  AGTTTTCTGAATAAAGCATCTGCTGTTTACCAGGCTCTTCAGAAGAGTAATGGTGTACTTCCTGAATTATTTCA  356

Query 519  GTGTCATGGTACTGCAGATGAGTTAGTTCTTCATTCTTGGGCAGAAGAGACAAACTCAATGTTAAAATCTCTAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  GTGTCATGGTACTGCAGATGAGTTAGTTCTTCATTCTTGGGCAGAAGAGACAAACTCAATGTTAAAATCTCTAG  430

Query 593  GAGTGACCACGAAGTTTCATAGTTTTCCAAATGTTTACCATGAGCTAAGCAAAACTGAGTTAGACATATTGAAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431  GAGTGACCACGAAGTTTCATAGTTTTCCAAATGTTTACCATGAGCTAAGCAAAACTGAGTTAGACATATTGAAG  504

Query 667  TTATGGATTCTTACAAAGCTGCCAGGAGAAATGGAAAAACAAAAA  711
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505  TTATGGATTCTTACAAAGCTGCCAGGAGAAATGGAAAAACAAAAA  549