Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04845
• Subject: XM_017027645.1
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1023
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGGCCCTCCGGAGTGCGCAGGGCGACGGCCCCACCTCCGGCCACTGGGACGGCGGCGCGGAGAAGGCAGACTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct    1  ATGGCCCTCCGGAGTGCGCAGGGCGACGGCCCCACCTCCGGCCACTGGGACGGCGGCGCGGAGAAGG-------  67

Query   75  TAACGCCAAAAGGAAAAAGAAAGTGGCAGAGATACACCAGGCTCTGAACAGTGATCCCACTGATGTGGCTGCCC  148
                                                                                      
Sbjct   68  --------------------------------------------------------------------------  67

Query  149  TTAGACGCATGGCTATCAGTGAAGGAGGGCTCCTGACTGATGAGATCAGACGAAAAGTGTGGCCCAAGCTCCTC  222
                                                                                      
Sbjct   68  --------------------------------------------------------------------------  67

Query  223  AATGTCAATGCCAATGACCCACCTCCTATATCAGGGAAGAACCTACGGCAGATGAGCAAGGACTACCAACAAGT  296
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  -------------------------------CAGGGAAGAACCTACGGCAGATGAGCAAGGACTACCAACAAGT  110

Query  297  GTTGCTGGACGTCCGGCGGTCATTGCGGCGGTTCCCTCCTGGCATGCCAGAGGAACAGAGAGAAGGGCTCCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  111  GTTGCTGGACGTCCGGCGGTCATTGCGGCGGTTCCCTCCTGGCATGCCAGAGGAACAGAGAGAAGGGCTCCAGG  184

Query  371  AAGAACTGATTGACATCATCCTCCTCATCTTGGAGCGCAACCCTCAGCTGCACTACTACCAGGGCTACCATGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  AAGAACTGATTGACATCATCCTCCTCATCTTGGAGCGCAACCCTCAGCTGCACTACTACCAGGGCTACCATGAC  258

Query  445  ATTGTGGTCACATTTCTGCTGGTGGTAGGCGAGAGGCTGGCAACATCCCTGGTAGAAAAATTATCTACCCACCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  ATTGTGGTCACATTTCTGCTGGTGGTAGGCGAGAGGCTGGCAACATCCCTGGTAGAAAAATTATCTACCCACCA  332

Query  519  CCTCAGGGATTTTATGGATCCAACAATGGACAACACCAAGCATATATTAAACTATCTGATGCCCATCATTGACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  CCTCAGGGATTTTATGGATCCAACAATGGACAACACCAAGCATATATTAAACTATCTGATGCCCATCATTGACC  406

Query  593  AGGTGAATCCAGAGCTCCATGACTTCATGCAGAGTGCTGAGGTAGGGACCATCTTTGCCCTCAGCTGGCTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  AGGTGAATCCAGAGCTCCATGACTTCATGCAGAGTGCTGAGGTAGGGACCATCTTTGCCCTCAGCTGGCTCATC  480

Query  667  ACCTGGTTTGGGCATGTCCTGTCTGACTTCAGGCACGTCGTGCGGTTATATGACTTCTTCCTGGCCTGCCACCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ACCTGGTTTGGGCATGTCCTGTCTGACTTCAGGCACGTCGTGCGGTTATATGACTTCTTCCTGGCCTGCCACCC  554

Query  741  ACTGATGCCGATTTACTTTGCAGCCGTGATTGTGTTGTATCGCGAGCAGGAAGTCCTGGACTGTGACTGTGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  ACTGATGCCGATTTACTTTGCAGCCGTGATTGTGTTGTATCGCGAGCAGGAAGTCCTGGACTGTGACTGTGACA  628

Query  815  TGGCCTCGGTCCACCACCTGTTGTCCCAGATCCCTCAGGACTTGCCCTATGAGACACTGATCAGCAGAGCAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  TGGCCTCGGTCCACCACCTGTTGTCCCAGATCCCTCAGGACTTGCCCTATGAGACACTGATCAGCAGAGCAGGA  702

Query  889  GACCTTTTTGTTCAGTTTCCCCCATCCGAACTTGCTCGGGAGGCCGCTGCCCAACAGCAAGCTGAGAGGACGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  GACCTTTTTGTTCAGTTTCCCCCATCCGAACTTGCTCGGGAGGCCGCTGCCCAACAGCAAGCTGAGAGGACGGC  776

Query  963  AGCCTCTACTTTCAAAGACTTTGAGCTGGCATCAGCCCAGCAGAGGCCTGATATGGTGCTGCGGCAGCGGTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  AGCCTCTACTTTCAAAGACTTTGAGCTGGCATCAGCCCAGCAGAGGCCTGATATGGTGCTGCGGCAGCGGTTTC  850

Query 1037  GGGGACTTCTGCGGCCTGAAGATCGAACAAAAGATGTCCTGACCAAGCCAAGGACCAACCGCTTTGTGAAATTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  GGGGACTTCTGCGGCCTGAAGATCGAACAAAAGATGTCCTGACCAAGCCAAGGACCAACCGCTTTGTGAAATTG  924

Query 1111  GCAGTGATGGGGCTGACAGTGGCACTTGGAGCGGCTGCACTGGCTGTGGTGAAAAGTGCCCTGGAATGGGCCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  GCAGTGATGGGGCTGACAGTGGCACTTGGAGCGGCTGCACTGGCTGTGGTGAAAAGTGCCCTGGAATGGGCCCC  998

Query 1185  TAAGTTTCAGCTGCAGCTGTTTCCC  1209
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  TAAGTTTCAGCTGCAGCTGTTTCCC  1023