Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04855
• Subject: NM_024237.4
• Aligned Length: 1321
• Identities: 1019
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCAGCTCTCCGCGCGCGCTCTTCCTTCTGCTCCTGATCCTCGCCTGCCCC-GAGCCGCGGGCTTCCC  73
            ||||..||..||||.|.|||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||.||||| ||| |||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGACCGGGCTCACAGCGCGCGCTTTTCCTCCTCTTGCTGCTCCTCGCCAGCCCCGGAG-CGCGGGCTTTCC  73

Query   74  AGAACTGTCTCAGCAAACAGCAGCTCCTCTCGGCCATCCGCCAGCTGCAGCAGCTGCTGAAGGGCCAGGAGACA  147
            |||.||||||||.||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct   74  AGAGCTGTCTCAACAAACAGCAGCTCCTCACCACCATCCGCCAGCTGCAGCAGCTGCTGAAAGGCCAGGAGACC  147

Query  148  CGCTTCGCCGAGGGCATCCGCCACATGAAGAGCCGGCTGGCCGCGCTGCAGAACTCTGTGGGCAGGGTGGGCCC  221
            ||||||.||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.||...||...||..|||
Sbjct  148  CGCTTCACCGAAGGCATCCGAAACATGAAGAGCCGGCTGGCTGCACTGCAAAACACGGTTAACAAAATGACCCC  221

Query  222  AGATGCCCTTCCAGTTTCCTGCCCGGCTCTGAACACCCCCGCAGACGGCAGAAAGTTTGGAAGCAAGTACTTAG  295
            .|||||.|..||||||||||||||.||||||.|..||||..|.||.||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGATGCACCACCAGTTTCCTGCCCAGCTCTGGAGGCCCCTCCGGATGGCAAGAAGTTTGGAAGCAAGTACTTAG  295

Query  296  TGGATCACGAAGTCCATTTTACCTGCAACCCTGGGTTCCGGCTGGTCGGGCCCAGCAGCGTGGTGTGTCTTCCC  369
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  296  TGGACCATGAAGTCTATTTTACCTGCAACCCTGGGTTCCAGCTGGTTGGGCCCAGCAGCGTGGTGTGTCTTGCT  369

Query  370  AATGGCACCTGGACAGGGGAGCAGCCCCACTGTAGAGGTATCAGTGAATGCTCCAGCCAGCCTTGTCAAAATGG  443
            |||||.|.|||||||||.||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  370  AATGGTAGCTGGACAGGAGAGCAGCCCCGCTGCAGAGATATCAGTGAATGCTCCAGCCAGCCTTGTCACAATGG  443

Query  444  TGGTACATGTGTAGAAGGAGTCAACCAGTACAGATGCATTTGTCCTCCAGGAAGGACTGGGAACCGCTGTCAGC  517
            .||.||.|||||.|||||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  444  AGGGACGTGTGTGGAAGGCATCAACCACTACAGATGCATCTGTCCTCCAGGAAAAACTGGGAACCGCTGTCAGC  517

Query  518  ATCAGGCCCAGACT------------------------------------------------------------  531
            |||||.|||||.||                                                            
Sbjct  518  ATCAGACCCAGGCTGCGGCCCCAGATGGCGGCGAGGCCGGTGACCCCGCCTTCAGCCGCGCACCCCGCTGCGCG  591

Query  532  --------------------------------------------------------------------------  531
                                                                                      
Sbjct  592  CAGGTGGAGCGGGAACAGCATTGCAGCTGCGAGGCGGGATTCCACCTGAGCAGCACCACGGGCGGCCACAGCGT  665

Query  532  -------GACGTGAACGAGTGTGAGCTCTACGGGCAGGAGGGGCGCCCCCGGCTCTGCATGCACGCCTGCGTGA  598
                   ||.|||||.|||||||||.||||.||||||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  666  CTGCCAGGATGTGAATGAGTGTGAGATCTATGGGCAGAAAGGACGCCCCCGGCTCTGCATGCATGCCTGTGTGA  739

Query  599  ACACCCCGGGCTCTTACCGTTGCACCTGCCCCGGTGGATACCGAACTCTGGCTGACGGGAAGAGCTGTGAGGAT  672
            |||||||.||.||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|..||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  740  ACACCCCTGGTTCCTACCGATGTACCTGCCCGAGTGGATACCGGATCCTGGCTGATGGGAAGAGCTGTGAGGAT  813

Query  673  GTGGATGAATGTGTGGGCCTGCAGCCGGTGTGCCCCCAGGGGACCACATGCATCAACACCGGTGGAAGCTTCCA  746
            ||.|||||.||||..||||..||||...|||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||
Sbjct  814  GTTGATGAGTGTGCAGGCCCACAGCACATGTGCCCCCGGGGGACCACATGCATCAACACTGGAGGAGGCTTCCA  887

Query  747  GTGTGTCAGCCCTGAGTGCCCCGAGGGCAGCGGCAATGTGAGCTACGTGAAGACGTCTCCATTCCAGTGTGAGC  820
            ||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  888  GTGTGTCAACCCTGAGTGTCCTGAGGGCAGCGGCAATATAAGCTACGTGAAGACATCTCCCTTTCAGTGCGAGC  961

Query  821  GGAACCCCTGCCCCATGGACAGCAGGCCCTGCCGCCATCTGCCCAAGACCATCTCCTTCCATTACCTCTCTCTG  894
            |.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  962  GAAACCCTTGTCCCATGGACAGCAGGCCATGCCGCCACCTGCCCAAGACCATCTCCTTCCATTACCTCTCTCTC  1035

Query  895  CCTTCCAACCTGAAGACGCCCATCACGCTCTTCCGCATGGCCACAGCCTCTGCCCCCGGCCGAGCTGGGCCCAA  968
            ||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||....||.||||...||||||||||
Sbjct 1036  CCTTCCAAGTTGAAGACACCCATCACGCTCTTCCGCATGGCCACAGCCTCAATTCCTGGCCATCCTGGGCCCAA  1109

Query  969  CAGCCTGCGGTTTGGGATCGTGGGTGGGAACAGCCGCGGCCACTTTGTGATGCAGCGTTCAGACCGGCAGACTG  1042
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1110  CAGCCTGCGCTTTGGGATCGTGGGTGGGAACAGCCGTGGCCACTTCGTAATGCAGCGCTCAGACCGGCAGACAG  1183

Query 1043  GGGATCTGATCCTTGTGCAGAACCTGGAGGGGCCTCAGACGCTGGAGGTGGACGTCGACATGTCGGAATACCTG  1116
            |.||.||.||||||...||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GAGAGCTCATCCTTACACAGACCCTGGAGGGGCCTCAGACTCTGGAGGTTGACGTAGACATGTCGGAATACCTG  1257

Query 1117  GACCGCTCCTTCCAGGCCAACCACGTGTCCAAGGTCACCATCTTTGTATCCCCCTATGACTTC  1179
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|.||||||||||
Sbjct 1258  GAGCGCTCCTTCCAGGCCAACCATGTATCCAAGGTCACCATCTTTGTTTCTCGCTATGACTTC  1320