Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04855
• Subject: XM_011510585.2
• Aligned Length: 1360
• Identities: 1172
• Gaps: 182

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCAGCTCTCCGCGCGCGCTCTTCCTTCTGCTCCTGATCCTCGCCTGCCCCGAGCCGCGGGCTTCCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCCAGCTCTCCGCGCGCGCTCTTCCTTCTGCTCCTGATCCTCGCCTGCCCCGAGCCGCGGGCTTCCCA  74

Query   75  GAACTGTCTCAGCAAACAGCAGCTCCTCTCGGCCATCCGCCAGCTGCAGCAGCTGCTGAAGGGCCAGGAGACAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACTGTCTCAGCAAACAGCAGCTCCTCTCGGCCATCCGCCAGCTGCAGCAGCTGCTGAAGGGCCAGGAGACAC  148

Query  149  GCTTCGCCGAGGGCATCCGCCACATGAAGAGCCGGCTGGCCGCGCTGCAGAACTCTGTGGGCAGGGTGGGCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCGCCGAGGGCATCCGCCACATGAAGAGCCGGCTGGCCGCGCTGCAGAACTCTGTGGGCAGGGTGGGCCCA  222

Query  223  GATGCCCTTCCAGTTTCCTGCCCGGCTCTGAACACCCCCGCAGACGGCAGAAAGTTTGGAAGCAAGTACTTAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGCCCTTCCAGTTTCCTGCCCGGCTCTGAACACCCCCGCAGACGGCAGAAAGTTTGGAAGCAAGTACTTAGT  296

Query  297  GGATCACGAAGTCCATTTTACCTGCAACCCTGGGTTCCGGCTGGTCGGGCCCAGCAGCGTGGTGTGTCTTCCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATCACGAAGTCCATTTTACCTGCAACCCTGGGTTCCGGCTGGTCGGGCCCAGCAGCGTGGTGTGTCTTCCCA  370

Query  371  ATGGCACCTGGACAGGGGAGCAGCCCCACTGTAGAGGTATCAGTGAATGCTCCAGCCAGCCTTGTCAAAATGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGCACCTGGACAGGGGAGCAGCCCCACTGTAGAGGTATCAGTGAATGCTCCAGCCAGCCTTGTCAAAATGGT  444

Query  445  GGTACATGTGTAGAAGGAGTCAACCAGTACAGATGCATTTGTCCTCCAGGAAGGACTGGGAACCGCTGTCAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTACATGTGTAGAAGGAGTCAACCAGTACAGATGCATTTGTCCTCCAGGAAGGACTGGGAACCGCTGTCAGCA  518

Query  519  TCAGGCCCAGACT-------------------------------------------------------------  531
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  519  TCAGGCCCAGACTGCCGCCCCCGAGGGCAGCGTGGCCGGCGACTCCGCCTTCAGCCGCGCGCCGCGCTGTGCGC  592

Query  532  --------------------------------------------------------------------------  531
                                                                                      
Sbjct  593  AGGTGGAGCGGGCTCAGCACTGCAGCTGCGAGGCCGGATTCCACCTGAGCGGCGCCGCCGGCGACAGCGTCTGC  666

Query  532  ---GACGTGAACGAGTGTGAGCTCTACGGGCAGGAGGGGCGCCCCCGGCTCTGCATGCACGCCTGCGTGAACAC  602
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGACGTGAACGAGTGTGAGCTCTACGGGCAGGAGGGGCGCCCCCGGCTCTGCATGCACGCCTGCGTGAACAC  740

Query  603  CCCGGGCTCTTACCGTTGCACCTGCCCCGGTGGATACCGAACTCTGGCTGACGGGAAGAGCTGTGAGGATGTGG  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCGGGCTCTTACCGTTGCACCTGCCCCGGTGGATACCGAACTCTGGCTGACGGGAAGAGCTGTGAGGATGTGG  814

Query  677  ATGAATGTGTGGGCCTGCAGCCGGTGTGCCCCCAGGGGACCACATGCATCAACACCGGTGGAAGCTTCCAGTGT  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGAATGTGTGGGCCTGCAGCCGGTGTGCCCCCAGGGGACCACATGCATCAACACCGGTGGAAGCTTCCAGTGT  888

Query  751  GTCAGCCCTGAGTGCCCCGAGGGCAGCGGCAATGTGAGCTACGTGAAGACGTCTCCATTCCAGTGTGAGCGGAA  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCAGCCCTGAGTGCCCCGAGGGCAGCGGCAATGTGAGCTACGTGAAGACGTCTCCATTCCAGTGTGAGCGGAA  962

Query  825  CCCCTGCCCCATGGACAGCAGGCCCTGCCGCCATCTGCCCAAGACCATCTCCTTCCATTACCTCTCTCTGCCTT  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCTGCCCCATGGACAGCAGGCCCTGCCGCCATCTGCCCAAGACCATCTCCTTCCATTACCTCTCTCTGCCTT  1036

Query  899  CCAACCTGAAGACGCCCATCACGCTCTTCCGCATGGCCACAGCCTCTGCCCCCGGCCGAGCTGGGCCCAACAGC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAACCTGAAGACGCCCATCACGCTCTTCCGCATGGCCACAGCCTCTGCCCCCGGCCGAGCTGGGCCCAACAGC  1110

Query  973  CTGCGGTTTGGGATCGTGGGTGGGAACAGCCGCGGCCACTTTGTGATGCAGCGTTCAGACCGGCAGACTGGGGA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCGGTTTGGGATCGTGGGTGGGAACAGCCGCGGCCACTTTGTGATGCAGCGTTCAGACCGGCAGACTGGGGA  1184

Query 1047  TCTGATCCTTGTGCAGAACCTGGAGGGGCCTCAGACGCTGGAGGTGGACGTCGACATGTCGGAATACCTGGACC  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGATCCTTGTGCAGAACCTGGAGGGGCCTCAGACGCTGGAGGTGGACGTCGACATGTCGGAATACCTGGACC  1258

Query 1121  GCTCCTTCCAGGCCAACCACGTGTCCAAGG-TCACCATC--------------------------TTTGTATCC  1167
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||.|.||                          ..||| |||
Sbjct 1259  GCTCCTTCCAGGCCAACCACGTGTCCAAGGCTCAGCTTCGGGCACCGACTGCGTGGAGCCTCCCGCCTGT-TCC  1331

Query 1168  --CCCTAT--------------GACTTC  1179
              ||||.|              |.||||
Sbjct 1332  CGCCCTCTCACCAGTGCACCCAGGCTTC  1359