Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04869
• Subject: NM_153429.1
• Aligned Length: 1725
• Identities: 1671
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAAGAAGATGAGCAACAT  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGTAGAACCCAGCAGCTCAGAATCCATTAAAAGGAGAGCTGGGAGGAGAATGAAGAAGATGAGCAACAT  74

Query   21  TTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAAAGTTGAGCTGCGTGTGGCGT  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAAAGTTGAGCTGCGTGTGGCGT  148

Query   95  GCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCCTCAAGATGCAGTCTCATGGG  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCCTCAAGATGCAGTCTCATGGG  222

Query  169  CAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTGTACTCAAAACTGTTTACTGT  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTGTACTCAAAACTGTTTACTGT  296

Query  243  GGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAGCAGCAACCACAATGGGCTGA  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAGCAGCAACCACAATGGGCTGA  370

Query  317  AGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCCAGAGAAAGCTGTCCAAATCC  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCCAGAGAAAGCTGTCCAAATCC  444

Query  391  TTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAAGAATTATCTGGCAATGACGA  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAAGAATTATCTGGCAATGACGA  518

Query  465  CTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAGTAAATCTGACCCATTTCTGG  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAGTAAATCTGACCCATTTCTGG  592

Query  539  AAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGGTTGTGATGAATAACTTAAGC  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGGTTGTGATGAATAACTTAAGC  666

Query  613  CCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCAGACCGCCGGCTAAAGTGCAT  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCAGACCGCCGGCTAAAGTGCAT  740

Query  687  AGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCAAGGAGATGAGAG  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCAAGGAGATGAGAG  814

Query  761  GAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAGAAGAATTACAAG  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAGAAGAATTACAAG  888

Query  835  AACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTACATCATGGGTGG  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTACATCATGGGTGG  962

Query  909  CTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACAGCTGTTCCTTGC  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACAGCTGTTCCTTGC  1036

Query  983  ACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATTTGCCAAGACTAT  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATTTGCCAAGACTAT  1110

Query 1057  GACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGTCTCTCATGACTT  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGTCTCTCATGACTT  1184

Query 1131  TGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCTATCAGAGCTGTC  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCTATCAGAGCTGTC  1258

Query 1205  TTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAGTCAGCGTCAGAG  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAGTCAGCGTCAGAG  1332

Query 1279  GAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAATACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGATGGTGTTATCACAGACATGGC  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAATACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGATGGTGTTATCACAGACATGGC  1406

Query 1353  CGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGCCTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCATCGTGGGAGTAGGGAACGCTG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGCCTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCATCGTGGGAGTAGGGAACGCTG  1480

Query 1427  ACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACGGTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCAAGGGAGAGCCTGTTCTTCGA  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACGGTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCAAGGGAGAGCCTGTTCTTCGA  1554

Query 1501  GACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGGAACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCCCTGGCAAAGAGCGTGCTGGC  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGGAACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCCCTGGCAAAGAGCGTGCTGGC  1628

Query 1575  TGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTATTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAAATGTTCATCAGAAATGTATG  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTATTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAAATGTTCATCAGAAATGTATG  1702

Query 1649  AATCTTCCAGAACACTAGCACCA  1671
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AATCTTCCAGAACACTAGCACCA  1725