Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04869
• Subject: XM_017005694.2
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1302
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGAAGAA  8
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ATGCCCTGCCCAGTGAAGAGGAATCTAGAGAGGCAGCCTGGCCACAGCCGCTTCGCTGCCCTGCGAATGAAGAA  74

Query    9  GATGAGCAACATTTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAAAGTTGAGC  82
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATGAGCAACATTTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAAAGTTGAGC  148

Query   83  TGCGTGTGGCGTGCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCCTCAAGATG  156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCGTGTGGCGTGCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCCTCAAGATG  222

Query  157  CAGTCTCATGGGCAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTGTACTCAAA  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTCTCATGGGCAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTGTACTCAAA  296

Query  231  ACTGTTTACTGTGGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAGCAGCAACC  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGTTTACTGTGGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAGCAGCAACC  370

Query  305  ACAATGGGCTGAAGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCCAGAGAAAG  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAATGGGCTGAAGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCCAGAGAAAG  444

Query  379  CTGTCCAAATCCTTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAAGAATTATC  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGTCCAAATCCTTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAAGAATTATC  518

Query  453  TGGCAATGACGACTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAGTAAATCTG  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCAATGACGACTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAGTAAATCTG  592

Query  527  ACCCATTTCTGGAAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGGTTGTGATG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCATTTCTGGAAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGGTTGTGATG  666

Query  601  AATAACTTAAGCCCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCAGACCGCCG  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAACTTAAGCCCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCAGACCGCCG  740

Query  675  GCTAAAGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCA  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTAAAGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCA  814

Query  749  AGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAG  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAG  888

Query  823  AAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTA  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTA  962

Query  897  CATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACA  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACA  1036

Query  971  GCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATT  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATT  1110

Query 1045  TGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGT  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGT  1184

Query 1119  CTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCT  1258

Query 1193  ATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAG  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAG  1332

Query 1267  TCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAATACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGATGGTGTTAT  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 1333  TCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCG--------------------------------------  1368

Query 1341  CACAGACATGGCCGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGCCTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCATCGTGGGAG  1414
                                                                                      
Sbjct 1369  --------------------------------------------------------------------------  1368

Query 1415  TAGGGAACGCTGACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACGGTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCAAGGGAGAG  1488
                                                                                      
Sbjct 1369  --------------------------------------------------------------------------  1368

Query 1489  CCTGTTCTTCGAGACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGGAACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCCCTGGCAAA  1562
                                                                                      
Sbjct 1369  --------------------------------------------------------------------------  1368

Query 1563  GAGCGTGCTGGCTGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTATTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAAATGTTCAT  1636
                                                                                      
Sbjct 1369  --------------------------------------------------------------------------  1368

Query 1637  CAGAAATGTATGAATCTTCCAGAACACTAGCACCA  1671
                                               
Sbjct 1369  -----------------------------------  1368