Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04882
• Subject: NM_177304.4
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1120
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGAAGCTTGGGACCCTCCTGCTGGCCCTTG-----CCCTGGGCCTGGCCCAGCCAGCCTCTGCCCGC  69
            |||||||..|||||..|||||.|||||||||.|.|||     ..|||||..||     |||.||.|||||||.|
Sbjct    1  ATGGCAGCAAAGCTCTGGACCTTCCTGCTGGGCTTTGGGCTCAGCTGGGTGTG-----GCCGGCTTCTGCCCAC  69

Query   70  CGGAAGCTGCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCAGACTACATCAGTGATGAGGCGCTGGAGTCATTGCC  143
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|..||.|||||
Sbjct   70  CGGAAGCTCCTGGTGTTGCTCCTGGATGGTTTTCGCTCAGACTACATCAGTGAGGATGCTCTAGCATCCTTGCC  143

Query  144  TGGTTTCAAAGAGATTGTGAGCAGGGGAGTAAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTCCCTAGTCTCTCGTATC  217
            |||.||||.|||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  144  TGGCTTCAGAGAGATTGTGAACAGAGGCGTCAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTTCCCAGCCTCTCCTATC  217

Query  218  CCAATTATTATACCCTAATGACTGGCCGCCATTGTGAAGTCCATCAGATGATCGGGAACTACATGTGGGACCCC  291
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  218  CCAATTACTACACCCTCATGACTGGCCGCCACTGTGAGGTCCACCAGATGATCGGCAACTACATGTGGGATCCC  291

Query  292  ACCACCAACAAGTCCTTTGACATTGGCGTCAACAAAGACAGCCTAATGCCTCTCTGGTGGAATGGATCAGAACC  365
            |..|||||||||||.||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  292  AGAACCAACAAGTCATTTGACATCGGGGTCAACCGAGACAGCCTGATGCCCCTGTGGTGGAACGGGTCAGAACC  365

Query  366  TCTGTGGGTCACTCTGACCAAGGCCAAAAGGAAGGTCTACATGTACTACTGGCCAGGCTGTGAGGTTGAGATTC  439
            .||||||.|||||||||..||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  366  GCTGTGGATCACTCTGATGAAAGCCAGGAGGAAAGTCTACATGTATTACTGGCCCGGCTGTGAAGTTGAGATTC  439

Query  440  TGGGTGTCAGACCCACCTACTGCCTAGAATATAAAAATGTCCCAACGGATATCAATTTTGCCAATGCAGTCAGC  513
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  440  TTGGTGTCAGACCAACTTACTGCCTAGAATATAAAACTGTCCCAACAGATATCAACTTTGCGAATGCAGTTAGC  513

Query  514  GATGCTCTTGACTCCTTCAAGAGTGGCCGGGCCGACCTGGCAGCCATATACCATGAGCGCATTGACGTGGAAGG  587
            ||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  514  GATGCTCTCGACTCATTAAAGAGTGGCCGAGCGGATCTAGCAGCCATATACCATGAGCGCATCGATGTAGAAGG  587

Query  588  CCACCACTACGGGCCTGCATCTCCGCAGAGGAAAGATGCCCTCAAGGCTGTAGACACTGTCCTGAAGTACATGA  661
            .|||||||||||.|||.||||.||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  588  TCACCACTACGGCCCTTCATCACCTCAGAGAAAAGATGCCCTCAGAGCTGTGGACACTGTCCTGAAGTATATGA  661

Query  662  CCAAGTGGATCCAGGAGCGGGGCCTGCAGGACCGCCTGAACGTCATTATTTTCTCGGATCACGGAATGACCGAC  735
            .|.|||||||.|||||.||.|||||||||.|...|||.||||||||..|.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  662  TCCAGTGGATTCAGGACCGAGGCCTGCAGCAGGACCTAAACGTCATCCTCTTCTCAGACCATGGGATGACTGAC  735

Query  736  ATTTTCTGGATGGACAAAGTGATTGAGCTGAATAAGTACATCAGCCTGAATGACCTGCAGCAAGTGAAGGACCG  809
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  736  ATCTTCTGGATGGATAAAGTGATTGAGCTGAGCAACTACATCAGCCTGGACGACCTGCAGCAAGTGAAAGACCG  809

Query  810  CGGGCCTGTTGTGAGCCTTTGGCCGGCCCCTGGGAAACACTCTGAGATATATAACAAACTGAGCACAGTGGAAC  883
            .|||||.|||||||||||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||
Sbjct  810  AGGGCCCGTTGTGAGCCTGTGGCCAGTTCCTGGAAAACACTCTGAGATATATCACAAACTCCGCACAGTGGAAC  883

Query  884  ACATGACTGTCTACGAGAAAGAAGCCAT-CCCAAGCAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAGTTTGTCTCTCCTTT  956
            |||||||.||.||.|||||||||.|.|| ||||| ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  884  ACATGACCGTGTATGAGAAAGAATCAATACCCAA-CAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAATTTGTCTCTCCTTT  956

Query  957  GACTTTAGTGGCTGATGAAGGCTGGTTCATAACTGAGAATCGAGAGATGCTTCCGTTTTGGATGAACAGCACCG  1030
            |||..|.||||||||||||||.|||||||||.|.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  957  GACCCTGGTGGCTGATGAAGGATGGTTCATAGCAGAGAGTCGAGAGATGCTTCCATTTTGGATGAACAGCACGG  1030

Query 1031  GCAGGCGGGAAGGTTGGCAGCGTGGATGGCACGGCTACGACAACGAGCTCATGGACATGCGGGGCATCTTCCTG  1104
            |||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1031  GCAAGCGTGAAGGCTGGCAGCGAGGATGGCACGGATATGACAACGAACTCATGGACATGAGAGGCATCTTCCTG  1104

Query 1105  GCCTTCGGACCTGATTTCAAATCCAACTTCAGAGCTGCTCCTATCAGGTCGGTGGACGTCTACAATGTCATGTG  1178
            |||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 1105  GCCATCGGACCTGATTTCAAGTCCAACTTCAGAGCTGCTCCAATCAGATCCGTGGATGTCTACAACATCATGTG  1178

Query 1179  CAATGTGGTGGGCATCACCCCGCTGCCCAACAACGGATCCTGGTCCAGGGTGATGTGCATGCTGAAGGGCCGCG  1252
            |.|.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||...
Sbjct 1179  CCACGTCGCAGGCATCACCCCACTGCCCAACAACGGGTCCTGGTCCAGGGTGGTATGCATGCTGAAGGGCCAGA  1252

Query 1253  CCAGCACTGC----CCCGCCTGTCTGGCCCAGCCACTGTGCCCTGGCACTGATTCTTCTCT--TCCTGCTTGCA  1320
            |||||.||||    |||.||...|||    |.|..||||||.||||...|||||||.||||  |.||  |||.|
Sbjct 1253  CCAGCTCTGCTCCACCCACCCCACTG----AACAGCTGTGCACTGGTCTTGATTCTCCTCTTATACT--TTGTA  1320