Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04926
• Subject: XM_017029271.1
• Aligned Length: 828
• Identities: 800
• Gaps: 24

Alignment

Query   1  -------ATGGCG-----GCCATCAGG---ATGGGAAAACTGACAACCATGCCTGCAGGTCTGATATATGCATC  59
                  ||||.|     |.||.||.|   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCATATGGTGAGAGTGGCAGCAAGAAAATGGGAAAACTGACAACCATGCCTGCAGGTCTGATATATGCATC  74

Query  60  TGTAAGTGTACATGCAGCCAAACAAGAGGAATCCAAAAAGCAGCTAGTGAAACCAGAGCAGCTCCCCATATATA  133
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGTAAGTGTACATGCAGCCAAACAAGAGGAATCCAAAAAGCAGCTAGTGAAACCAGAGCAGCTCCCCATATATA  148

Query 134  CTGCACCACCGCTCCAGTCTAAATATGTTGAAGAGCAGCCTGGTCATTTACAAATGGGCTTTGCTTCCATCCGC  207
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CTGCACCACCGCTCCAGTCTAAATATGTTGAAGAGCAGCCTGGTCATTTACAAATGGGCTTTGCTTCCATCCGC  222

Query 208  ACTGCAACTGGTTGTTACATTGGCTGGTGCAAGGGTGTTTATGTCTTTGTGAAAAATGGGATAATGGATACAGT  281
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACTGCAACTGGTTGTTACATTGGCTGGTGCAAGGGTGTTTATGTCTTTGTGAAAAATGGGATAATGGATACAGT  296

Query 282  ACAATTTGGAAAAGATGCTTATGTCTATCTGAAGAATCCTCCTCGAGATTTTCTTCCGAAAATGGGAGTTATTA  355
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACAATTTGGAAAAGATGCTTATGTCTATCTGAAGAATCCTCCTCGAGATTTTCTTCCGAAAATGGGAGTTATTA  370

Query 356  CAGTTTCAGGATTGGCGGGCTTGGTTTCAGCGAGAAAAGGTTCCAAGTTTAAGAAAATTACTTATCCTCTGGGA  429
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CAGTTTCAGGATTGGCGGGCTTGGTTTCAGCGAGAAAAGGTTCCAAGTTTAAGAAAATTACTTATCCTCTGGGA  444

Query 430  CTGGCCACTTTAGGAGCAACTGTTTGCTACCCAGTTCAGTCCGTAATAATTGCTAAGGTAACAGCAAAAAAGGT  503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTGGCCACTTTAGGAGCAACTGTTTGCTACCCAGTTCAGTCCGTAATAATTGCTAAGGTAACAGCAAAAAAGGT  518

Query 504  ATATGCTACAAGCCAGCAAATTTTTGGAGCAGTTAAATCATTGTGGACAAAAAGCAGCAAAGAAGAGTCACTCC  577
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ATATGCTACAAGCCAGCAAATTTTTGGAGCAGTTAAATCATTGTGGACAAAAAGCAGCAAAGAAGAGTCACTCC  592

Query 578  CTAAACCTAAAGAAAAAACTAAGCTAGGATCCTCTTCCGAAATAGAAGTACCTGCAAAAACAACTCACGTCTTG  651
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CTAAACCTAAAGAAAAAACTAAGCTAGGATCCTCTTCCGAAATAGAAGTACCTGCAAAAACAACTCACGTCTTG  666

Query 652  AAACACTCAGTGCCCTTGCCAACAGAACTCAGCTCTGAAGCAAAGACCAAATCAGAATCCACTTCA--------  717
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 667  AAACACTCAGTGCCCTTGCCAACAGAACTCAGCTCTGAAGCAAAGACCAAATCAGAATCCACTTCAGGTTTGTT  740

Query 718  -GGTGCAACCCAGTTTATGCCTGACCCCAAGCTCATGGATCACGGGCAGTCCCACCCAGAAGATATAGATATGT  790
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GGGTGCAACCCAGTTTATGCCTGACCCCAAGCTCATGGATCACGGGCAGTCCCACCCAGAAGATATAGATATGT  814

Query 791  ACAGCACTAGAAGC  804
           ||||||||||||||
Sbjct 815  ACAGCACTAGAAGC  828