Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04968
- Subject:
- XM_006520266.3
- Aligned Length:
- 2497
- Identities:
- 2118
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGCCTTTGGAGATGGAGCCCAAGATGAGCAAACTGGCCTTTGGCTGTCAGAGAAGTTCCACATCAGATGATGA 74
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTTTGGAGATGGAACCGAAAATGAGCAAACTGGTCTTCGGGTGCCAGAGAAGCTCCACATCAGATGATGA 74
Query 75 CTCTGGCTGTGCATTGGAGGAGTACGCCTGGGTCCCCCCGGGCCTGAGACCAGAGCAGATCCAGCTCTATTTTG 148
.||.|||||||||.|.||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 TTCCGGCTGTGCACTTGAAGAGTATGCATGGGTCCCACCGGGCCTCAGGCCCGAGCAGATCCAGCTCTATTTCG 148
Query 149 CTTGCTTACCAGAGGAAAAAGTTCCTTACGTTAACAGCCCCGGAGAGAAGCATCGGATTAAACAGCTTTTGTAC 222
|.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||..|||||||||||||..|||||
Sbjct 149 CATGCTTGCCAGAGGAAAAGGTTCCTTATGTTAACAGCCCTGGGGAGAAACACAGGATTAAACAGCTCCTGTAC 222
Query 223 CAGTTACCACCACATGATAATGAGGTACGGTATTGCCAGTCTTTGAGTGAAGAGGAGAAAAAAGAGTTGCAGGT 296
|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||
Sbjct 223 CAGTTGCCTCCACACGATAACGAGGTGCGGTACTGCCAGTCTTTGAGCGAAGAAGAGAAGAAGGAGCTGCAGGT 296
Query 297 GTTCAGTGCTCAGCGGAAGAAAGAAGCACTGGGAAGAGGAACAATTAAGCTTCTGTCCAGAGCAGTCATGCATG 370
|||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||..||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 297 GTTCAGTGCTCAGAGGAAGAAAGAAGCTCTGGGGAGAGGAACCATCAAACTCTTGTCCAGAGCTGTGATGCACG 370
Query 371 CTGTGTGTGAGCAGTGTGGTTTGAAGATAAATGGAGGTGAAGTTGCAGTGTTCGCCTCCCGTGCGGGCCCTGGT 444
|.|||||||||||||||||..||.||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 371 CCGTGTGTGAGCAGTGTGGGCTGCAGATGAATGGAGGGGAGGTGGCCGTGTTCGCCTCCCGTGCAGGACCTGGA 444
Query 445 GTGTGCTGGCACCCATCCTGTTTTGTCTGTTTCACGTGTAATGAGCTGCTGGTCGACCTCATCTATTTTTATCA 518
||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 GTATGCTGGCACCCGTCCTGCTTTGTCTGCTTCACGTGTAATGAACTACTGGTCGACCTCATCTATTTCTATCA 518
Query 519 GGATGGAAAAATTCACTGTGGCAGGCACCATGCAGAACTGCTCAAACCACGGTGCTCAGCATGTGACGAGATAA 592
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 519 GGATGGAAAAATCCACTGTGGCAGGCACCACGCTGAACTGCTCAAGCCTCGGTGCTCAGCCTGTGATGAGATCA 592
Query 593 TTTTTGCTGATGAGTGCACAGAAGCTGAGGGTCGCCATTGGCACATGAAACACTTCTGCTGCCTTGAGTGTGAA 666
||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 593 TTTTTGCTGACGAGTGCACGGAAGCCGAGGGTCGCCACTGGCACATGAAGCATTTCTGCTGTCTGGAATGTGAG 666
Query 667 ACGGTCCTGGGAGGACAGAGGTATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGTTTTGAGTCTCTCTA 740
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 667 ACAGTCCTGGGAGGGCAGAGATATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGCTTCGAGTCTCTCTA 740
Query 741 TGCGGAGTACTGTGAAACCTGTGGGGAACATATTGGTGTGGACCATGCACAGATGACCTATGACGGGCAGCACT 814
.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 CGCTGAGTACTGCGAAACCTGTGGGGAGCATATTGGTGTGGACCACGCACAGATGACCTACGACGGGCAGCACT 814
Query 815 GGCACGCCACGGAAGCCTGCTTTTCTTGTGCCCAGTGTAAAGCCTCTTTGTTGGGATGTCCCTTCCTTCCCAAA 888
||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 815 GGCACGCCACAGAGGCCTGCTTTTCCTGTGCGCAGTGTAAGGCCTCGTTGCTGGGATGCCCCTTCCTCCCGAAA 888
Query 889 CAGGGTCAGATTTACTGCTCAAAAACGTGCAGTCTTGGTGAAGACGTCCATGCCTCTGATTCTTCCGACTCTGC 962
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 889 CAAGGTCAGATTTACTGCTCCAAGACCTGCAGCCTTGGGGAAGACATCCACGCCTCTGACTCCTCGGACTCCGC 962
Query 963 ATTTCAGTCAGCTCGATCAAGAGACTCCCGAAGAAGTGTCCGAATGGGCAAGAGCAGCCGGTCAGCAGATCAGT 1036
.||.||||||||..||||.||||||||.||.||.||.||..|.|||||||..||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 963 CTTCCAGTCAGCCAGATCCAGAGACTCTCGCAGGAGCGTGAGGATGGGCAGAAGCAGCCGCTCCGCCGACCAGT 1036
Query 1037 GTAGACAGTCTCTCCTCTTATCGCCTGCTCTGAACTACAAGTTTCCTGGCCTCTCAGGCAATGCTGATGACACC 1110
|..||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1037 GCCGACAGTCTCTTCTCTTGTCTCCCGCCCTGAACTACAAGTTCCCGGGTCTCTCCGGCAACGCTGACGACACC 1110
Query 1111 CTTTCTCGAAAATTGGATGATCTGAGTCTCTC---CAGACAAGGAACAAGTTTTGCCAGTGAAGAATTTTGGAA 1181
|||||.||.||..|||||||..||||.|||.| |||.||.|||.||.||||.||.|..||.|||||.|||||
Sbjct 1111 CTTTCCCGGAAGCTGGATGACGTGAGCCTCGCCAGCAGGCAGGGAGCAGGTTTCGCTAACGAGGAATTCTGGAA 1184
Query 1182 AGGCAGAGTAGAGCAGGAA-ACTCCAGAAGACCCTGAAGAATGGGCTGATCATGAAGATTATATGACGCAGCTC 1254
||.||||||.||||||||| .|||| ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCCAGAGTGGAGCAGGAAGCCTCC-GAAGACCCCGAAGAATGGGCTGAGCATGAAGATTATATGACGCAGCTC 1257
Query 1255 CTCCTCAAGTTTGGTGATAAAAGCCTCTTTCAGCCACAGCCCAATGAGATGGATATTCGAGCCAGTGAGCACTG 1328
|||||||||||.||.||.||||.||||||.||||..|||..||..|||.|||||....|||||||.||||||||
Sbjct 1258 CTCCTCAAGTTCGGCGACAAAAACCTCTTCCAGCAGCAGAGCAGCGAGGTGGATCCGAGAGCCAGCGAGCACTG 1331
Query 1329 GATATCTGATAACATGGTTAAAAGTAAGACCGAGTTAAAGCAAAATAACCAGAGCCTTGCAAGTAAAAAATACC 1402
||||.|.||.||||||||||..|.||||.|||||.||||||..|||.|||||.||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1332 GATACCCGACAACATGGTTACGAATAAGCCCGAGGTAAAGCCGAATCACCAGGGCCTCGCGAGTAAAAAGTATC 1405
Query 1403 AGTCTGATATGTACTGGGCACAGTCACAAGATGGACTGGGCGATTCTGCTTATGGCAGCCACCCAGGCCCTGCA 1476
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1406 AGTCTGATATGTACTGGGCCCAGTCCCAAGACGGGCTGGGTGACTCTGCCTACGGCAGCCATCCAGGCCCCGCC 1479
Query 1477 AGCAGTAGAAGGCTTCAGGAATTGGAACTGGACCATGGGGCTTCAGGGTATAATCATGATGAAACACAGTGGTA 1550
|||||..|.|||||.||.||..|.||.||||||||.||.|||.|.||.||||.||||||..|||..||||||||
Sbjct 1480 AGCAGCCGCAGGCTGCAAGAGCTAGATCTGGACCACGGTGCTGCGGGATATACTCATGACCAAAGCCAGTGGTA 1553
Query 1551 TGAAGATTCCCTGGAGTGTCTGTCAGACCTGAAACCAGAGCAAAGTGTTCGGGATTCGATGGATTCTTTGGCAT 1624
||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||.||.|||.|.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1554 TGAAGACTCCCTGGAGTGTCTATCTGACTTGAAACCAGAACAGAGTATCCGGGATTCTATGGATTCTTTGGCGT 1627
Query 1625 TGTCCAATATCACAGGGGCTTCGGTGGATGGAGAAAACAAGCCAAGGCCATCATTGTATTCTCTGCAAAATTTT 1698
|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1628 TGTCCAACATCACAGGGGCATCAGTGGATGGAGAAAGCAAGCCAAGACCGTCATTATATTCTCTCCAAAACTTT 1701
Query 1699 GAGGAGATGGAAACAGAAGATTGTGAGAAGATGAGCAATATGGGAACTTTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAG 1772
||||||||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GAGGAGATAGAGGCAGAAGATTGTGAGAAAATGAGCAATATGGGAACTCTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAG 1775
Query 1773 TGCAGAGTCCTTAAAGAGTCTAAGTTCAGAGTTGTGTCCAGAGAAAATCCTGCCTGAAGAGAAGCCAGTACATC 1846
||||||.||||||.|.|||||.|..||||.|.||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||.|||.|
Sbjct 1776 TGCAGAATCCTTACAAAGTCTGAACTCAGGGCTGTGCCCAGAAAAAATTCTACCTGAGGAAAAACCAGCACACC 1849
Query 1847 TGCCAGTGCTCAGAAGGTCCAAGTCTCAATCCAGACCCCAGCAGGTCAAGTTTTCTGATGATGTCATTGACAAT 1920
||||.||||||||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1850 TGCCGGTGCTCAGGAGATCCAAGTCCCAGTCCCGACCACAGCAGGTCAAATTTTCAGATGACGTCATTGACAAC 1923
Query 1921 GGGAACTATGACATTGAAATCCGGCAGCCTCCGATGAGTGAAAGGACTCGGAGACGCGTCTACAATTTTGAAGA 1994
||.|.|||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|..||..|.||||||||
Sbjct 1924 GGAAGCTACGACATCGAAATCCGGCAGCCTCCCATGAGCGAACGGACTCGGAGACGGGCGTATCACTTTGAAGA 1997
Query 1995 GAGGGGATCCAGGTCTCATCACCACCGCCGCCGGAGAAGTAGAAAGTCCCGCTCCGACAATGCCCTGAATCTTG 2068
|||||||||||||.||||.|||||.||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1998 GAGGGGATCCAGGCCTCACCACCATCGCCACCGGAGAAGCAGAAAGTCTCGGTCCGACAACGCCCTGAACCTGG 2071
Query 2069 TTACAGAAAGAAAATACTCTCCCAAGGACAGACTGCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTTATACAG 2142
|.||.|||||.||.|||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2072 TCACGGAAAGGAAGTACTCCGCCAAGGACAGACTTCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTCATACAG 2145
Query 2143 AATAAAAGTGCCCGGGAGATCCAAGCATACATCCAGAATGCTGATCTCTACGGACAGTACGCCCATGCCACTTC 2216
||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.|||||.||..|.|||||..|.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2146 AATAAAAGCGCCCGGGAGCTCCAAGCCTACATGCAGAACGCCAACCTCTATAGCCAGTATGCCCATGCCACGTC 2219
Query 2217 CGATTATGGCCTGCAGAACCCAGGAATGAATCGGTTTCTGGGACTCTACGGCGAGGATGATGATTCCTGGTGTT 2290
.|||||.|.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 2220 TGATTACGCCCTGCAGAACCCAGGGATGAACCGGTTTCTGGGGCTCTGCGGCGAGGACGACGACTCGTGGTGTT 2293
Query 2291 CTTCCTCCTCCTCCTCTTCCGACTCGGAAGAAGAAGGATATTTTCTTGGACAACCAATCCCTCAACCCCGGCCA 2364
|.||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2294 CGTCCTCCACGTCCTCCTCCGACTCAGAAGAAGAAGGCTATTTCCTTGGCCAGCCGATCCCTCAGCCACGGCCA 2367
Query 2365 CAGAGATTTGCCTACTATACAGATGACCTTTCTAGTCCACCATCTGCACTTCCCACCCCTCAGTTTGGTCAGAG 2438
||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||..|.||.|||||.||||||||.||||||..||||||
Sbjct 2368 CAGAGATTCACCTACTATACAGATGACCTTTCTAGCCCGGCTTCCGCACTGCCCACCCCACAGTTTACTCAGAG 2441
Query 2439 GACAACAAAATCCAAGAAGAAAAAGGGACACAAGGGCAAAAATTGTATTATTTCT 2493
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2442 GACAACTAAATCCAAGAAGAAAAAAGGACACAAGGGCAAAAACTGTATCATTTCT 2496