Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04982
• Subject: NM_001100915.3
• Aligned Length: 2778
• Identities: 2778
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGGAGTCTGGCATGGCTCATGAATCAGCAGAGGACTTGTTTCATTTCAACGTAGGGGGCTGGCATTTCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAGTCTGGCATGGCTCATGAATCAGCAGAGGACTTGTTTCATTTCAACGTAGGGGGCTGGCATTTCTC  74

Query   75  AGTTCCCAGAAGCAAACTCTCTCAGTTTCCAGACTCCCTGCTGTGGAAAGAGGCTTCAGCCTTGACCTCTTCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTCCCAGAAGCAAACTCTCTCAGTTTCCAGACTCCCTGCTGTGGAAAGAGGCTTCAGCCTTGACCTCTTCAG  148

Query  149  AAAGCCAGAGGCTATTTATCGACAGAGATGGTTCCACATTTAGGCACGTGCACTATTACCTCTACACCTCCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAGCCAGAGGCTATTTATCGACAGAGATGGTTCCACATTTAGGCACGTGCACTATTACCTCTACACCTCCAAA  222

Query  223  CTCTCCTTCTCCAGTTGTGCAGAACTGAACTTGCTGTATGAGCAAGCATTGGGTTTGCAGCTGATGCCTTTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTCCTTCTCCAGTTGTGCAGAACTGAACTTGCTGTATGAGCAAGCATTGGGTTTGCAGCTGATGCCTTTGCT  296

Query  297  GCAGACTCTAGATAACCTGAAGGAAGGGAAACACCATCTACGCGTACGGCCTGCAGACCTACCTGTTGCTGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGACTCTAGATAACCTGAAGGAAGGGAAACACCATCTACGCGTACGGCCTGCAGACCTACCTGTTGCTGAGA  370

Query  371  GAGCATCTCTGAACTACTGGCGTACATGGAAGTGTATTAGCAAACCCTCAGAATTTCCAATTAAAAGCCCAGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCATCTCTGAACTACTGGCGTACATGGAAGTGTATTAGCAAACCCTCAGAATTTCCAATTAAAAGCCCAGCC  444

Query  445  TTTACAGGCCTACATGATAAGGCACCTCTGGGGCTCATGGACACACCCCTGTTAGACACAGAAGAGGAGGTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTACAGGCCTACATGATAAGGCACCTCTGGGGCTCATGGACACACCCCTGTTAGACACAGAAGAGGAGGTGCA  518

Query  519  CTACTGCTTCCTGCCCCTAGACCTGGTGGCCAAATATCCCAGCCTAGTGACTGAAGACAACCTGCTGTGGCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACTGCTTCCTGCCCCTAGACCTGGTGGCCAAATATCCCAGCCTAGTGACTGAAGACAACCTGCTGTGGCTGG  592

Query  593  CTGAGACGGTGGCCCTCATCGAGTGCGAGTGCAGCGAGTTCCGCTTCATTGTGAATTTTCTTCGCTCACAGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAGACGGTGGCCCTCATCGAGTGCGAGTGCAGCGAGTTCCGCTTCATTGTGAATTTTCTTCGCTCACAGAAG  666

Query  667  ATTTTACTACCGGATAATTTCTCCAACATTGATGTATTAGAAGCAGAAGTGGAAATTCTGGAAATCCCTGCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTTTACTACCGGATAATTTCTCCAACATTGATGTATTAGAAGCAGAAGTGGAAATTCTGGAAATCCCTGCACT  740

Query  741  CACTGAAGCCGTAAGGTGGTACCGGATGAACATGGGTGGCTGTTCCCCGACCACCTGTTCTCCCCTGAGCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACTGAAGCCGTAAGGTGGTACCGGATGAACATGGGTGGCTGTTCCCCGACCACCTGTTCTCCCCTGAGCCCCG  814

Query  815  GGAAGGGGGCCCGCACAGCCAGCCTGGAGTCCGTGAAACCGCTCTACACAATGGCCCTGGGTCTGCTGGTCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAAGGGGGCCCGCACAGCCAGCCTGGAGTCCGTGAAACCGCTCTACACAATGGCCCTGGGTCTGCTGGTCAAG  888

Query  889  TACCCGGACTCTGCGCTGGGCCAGCTTCGCATCGAGAGCACGCTAGACGGAAGCCGACTGTACATCACAGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCCGGACTCTGCGCTGGGCCAGCTTCGCATCGAGAGCACGCTAGACGGAAGCCGACTGTACATCACAGGGAA  962

Query  963  TGGCGTCCTCTTTCAGCACGTCAAGAACTGGCTGGGGACTTGCCGGCTGCCCCTGACAGAGACCATTTCCGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCGTCCTCTTTCAGCACGTCAAGAACTGGCTGGGGACTTGCCGGCTGCCCCTGACAGAGACCATTTCCGAGG  1036

Query 1037  TATATGAGCTCTGTGCCTTCCTAGACAAAAGGGACATCACCTACGAGCCAATCAAAGTTGCTTTGAAGACTCAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATATGAGCTCTGTGCCTTCCTAGACAAAAGGGACATCACCTACGAGCCAATCAAAGTTGCTTTGAAGACTCAT  1110

Query 1111  CTGGAGCCAAGGACTTTGGCACCCATGGATGTGCTCAATGAGTGGACGGCAGAGATCACTGTGTATTCCCCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGAGCCAAGGACTTTGGCACCCATGGATGTGCTCAATGAGTGGACGGCAGAGATCACTGTGTATTCCCCACA  1184

Query 1185  ACAGATCATCAAAGTGTATGTTGGAAGCCACTGGTACGCAACCACCCTGCAGACACTGCTGAAGTATCCAGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGATCATCAAAGTGTATGTTGGAAGCCACTGGTACGCAACCACCCTGCAGACACTGCTGAAGTATCCAGAAC  1258

Query 1259  TGCTGTCCAACCCTCAGAGAGTGTACTGGATCACATATGGACAAACCCTGCTCATCCACGGGGATGGCCAGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGTCCAACCCTCAGAGAGTGTACTGGATCACATATGGACAAACCCTGCTCATCCACGGGGATGGCCAGATG  1332

Query 1333  TTCCGACACATTCTCAACTTCCTGAGACTTGGCAAACTGTTTTTACCATCTGAATTTAAGGAATGGCCCCTCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCCGACACATTCTCAACTTCCTGAGACTTGGCAAACTGTTTTTACCATCTGAATTTAAGGAATGGCCCCTCTT  1406

Query 1407  CTGCCAGGAGGTGGAGGAATACCACATTCCATCCCTCTCAGAAGCCCTTGCACAATGTGAAGCATACAAGTCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCCAGGAGGTGGAGGAATACCACATTCCATCCCTCTCAGAAGCCCTTGCACAATGTGAAGCATACAAGTCAT  1480

Query 1481  GGACTCAGGAGAAAGAATCTGAAAATGAAGAAGCTTTTTCCATCAGGAGGCTGCATGTGGTGACAGAAGGGCCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGACTCAGGAGAAAGAATCTGAAAATGAAGAAGCTTTTTCCATCAGGAGGCTGCATGTGGTGACAGAAGGGCCA  1554

Query 1555  GGGTCACTGGTGGAGTTCAGTAGAGACACTAAAGAAACCACAGCCTACATGCCTGTGGACTTCGAAGACTGCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGTCACTGGTGGAGTTCAGTAGAGACACTAAAGAAACCACAGCCTACATGCCTGTGGACTTCGAAGACTGCAG  1628

Query 1629  TGACAGGACTCCATGGAACAAGGCTAAGGGAAACCTGGTCAGGTCCAACCAGATGGATGAGGCTGAGCAGTACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGACAGGACTCCATGGAACAAGGCTAAGGGAAACCTGGTCAGGTCCAACCAGATGGATGAGGCTGAGCAGTACA  1702

Query 1703  CTCGGCCCATCCAGGTGTCCCTATGCCGAAATGCCAAGAGGGCTGGCAACCCTAGCACATACTCACACTGCCGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTCGGCCCATCCAGGTGTCCCTATGCCGAAATGCCAAGAGGGCTGGCAACCCTAGCACATACTCACACTGCCGT  1776

Query 1777  GGCTTGTGTACCAATCCTGGACACTGGGGGAGCCACCCTGAGAGCCCCCCAAAGAAGAAATGCACCACAATCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGCTTGTGTACCAATCCTGGACACTGGGGGAGCCACCCTGAGAGCCCCCCAAAGAAGAAATGCACCACAATCAA  1850

Query 1851  CCTCACACAGAAATCTGAAACCAAAGACCCTCCCGCCACTCCCATGCAAAAACTCATCTCCCTGGTGAGAGAAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTCACACAGAAATCTGAAACCAAAGACCCTCCCGCCACTCCCATGCAAAAACTCATCTCCCTGGTGAGAGAAT  1924

Query 1925  GGGACATGGTCAATTGCAAACAGTGGGAATTCCAGCCACTGACAGCCACACGGAGCAGCCCCTTGGAGGAGGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGGACATGGTCAATTGCAAACAGTGGGAATTCCAGCCACTGACAGCCACACGGAGCAGCCCCTTGGAGGAGGCC  1998

Query 1999  ACCCTGCAGCTCCCCTTGGGAAGCGAGGCTGCTTCCCAGCCCAGCACCTCAGCTGCCTGGAAAGCCCATTCCAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACCCTGCAGCTCCCCTTGGGAAGCGAGGCTGCTTCCCAGCCCAGCACCTCAGCTGCCTGGAAAGCCCATTCCAC  2072

Query 2073  AGCCTCAGAGAAGGATCCAGGACCACAGGCAGGGGCTGGAGCTGGAGCGAAAGACAAGGGGCCAGAGCCAACCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGCCTCAGAGAAGGATCCAGGACCACAGGCAGGGGCTGGAGCTGGAGCGAAAGACAAGGGGCCAGAGCCAACCT  2146

Query 2147  TCAAGCCATACTTACCCCCAAAAAGAGCTGGCACCCTGAAGGACTGGAGCAAGCAGAGGACCAAGGAGAGAGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCAAGCCATACTTACCCCCAAAAAGAGCTGGCACCCTGAAGGACTGGAGCAAGCAGAGGACCAAGGAGAGAGAA  2220

Query 2221  AGCCCTGCCCCTGAGCAGCCTCTGCCCGAGGCCAGTGAGGTGGACAGCCTAGGGGTTATCCTCAAAGTGACTCA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGCCCTGCCCCTGAGCAGCCTCTGCCCGAGGCCAGTGAGGTGGACAGCCTAGGGGTTATCCTCAAAGTGACTCA  2294

Query 2295  CCCCCCCGTGGTGGGCAGCGATGGCTTCTGCATGTTCTTTGAGGACAGCATCATCTATACCACGGAGATGGACA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCCCCCGTGGTGGGCAGCGATGGCTTCTGCATGTTCTTTGAGGACAGCATCATCTATACCACGGAGATGGACA  2368

Query 2369  ACCTCAGGCACACAACACCCACAGCCAGTCCCCAGCCCCAAGAAGTGACTTTCCTGAGTTTCTCTCTGTCCTGG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCTCAGGCACACAACACCCACAGCCAGTCCCCAGCCCCAAGAAGTGACTTTCCTGAGTTTCTCTCTGTCCTGG  2442

Query 2443  GAAGAGATGTTTTATGCACAGAAATGTCACTGCTTCCTGGCTGACATCATCATGGATTCCATCAGGCAAAAGGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAAGAGATGTTTTATGCACAGAAATGTCACTGCTTCCTGGCTGACATCATCATGGATTCCATCAGGCAAAAGGA  2516

Query 2517  CCCCAAAGCCATCACAGCCAAGGTGGTCTCCCTGGCCAATCGGCTGTGGACCCTGCACATCAGCCCCAAGCAGT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCCCAAAGCCATCACAGCCAAGGTGGTCTCCCTGGCCAATCGGCTGTGGACCCTGCACATCAGCCCCAAGCAGT  2590

Query 2591  TTGTGGTAGATTTGCTGGCCATCACCGGCTTCAAGGATGACCGGCACACCCAGGAGCGCCTGTACAGCTGGGTG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTGTGGTAGATTTGCTGGCCATCACCGGCTTCAAGGATGACCGGCACACCCAGGAGCGCCTGTACAGCTGGGTG  2664

Query 2665  GAGCTTACACTGCCCTTCGCCAGGAAATATGGCCGATGCATGGACCTGCTCATCCAGAGGGGCCTGTCTAGGTC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGCTTACACTGCCCTTCGCCAGGAAATATGGCCGATGCATGGACCTGCTCATCCAGAGGGGCCTGTCTAGGTC  2738

Query 2739  TGTCTCTTACTCCATCCTGGGAAAGTACCTACAAGAGGAC  2778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGTCTCTTACTCCATCCTGGGAAAGTACCTACAAGAGGAC  2778