Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04982
Subject:
NM_001301173.1
Aligned Length:
927
Identities:
823
Gaps:
1

Alignment

Query   1  MEESGMAHESAEDLFHFNVGGWHFSVPRSKLSQFPDSLLWKEASALTSSESQRLFIDRDGSTFRHVHYYLYTSK  74
           |||.|..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MEEPGGLHESAEDLFHFNVGGWHFSVPRSKLAQFPDSLLWKEASALTSSENQRLFIDRDGSTFRHVHYYLYTSK  74

Query  75  LSFSSCAELNLLYEQALGLQLMPLLQTLDNLKEGKHHLRVRPADLPVAERASLNYWRTWKCISKPSEFPIKSPA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  75  LSFSSCAELNLLYEQALGLQLMPLLQTLDNLKEGRHHLRVRPADIPVAERASLNYWRTWKCISKPSDFPIKSPA  148

Query 149  FTGLHDKAPLGLMDTPLLDTEEEVHYCFLPLDLVAKYPSLVTEDNLLWLAETVALIECECSEFRFIVNFLRSQK  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 149  FTGLHDKAPLGLMDTPLLDTEEEVHYCFLPLDLVAKYPSLVTEDNLLWLAETVALIECECSEFRFIVNFLRSHK  222

Query 223  ILLPDNFSNIDVLEAEVEILEIPALTEAVRWYRMNMGGCSPTTCSPLSPGKGARTASLESVKPLYTMALGLLVK  296
           |||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|.|.|||||||.||||.|||||||.||||||||
Sbjct 223  ILLPDNFSNIDVLEAEVEILEIPELTEAVRLYRMNMGGCSRTSCPPLSPGKGGRTASVESVKPLYLMALGLLVK  296

Query 297  YPDSALGQLRIESTLDGSRLYITGNGVLFQHVKNWLGTCRLPLTETISEVYELCAFLDKRDITYEPIKVALKTH  370
           ||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297  YPDSALGQLRIESTLDGSRLYITGNGALFQHVRNWLGTCRLPLTETISEVYELCAFLDKRDITYEPMKVALKTH  370

Query 371  LEPRTLAPMDVLN-EWTAEITVYSPQQIIKVYVGSHWYATTLQTLLKYPELLSNPQRVYWITYGQTLLIHGDGQ  443
           ||||||.|.|||. |||||.|.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 371  LEPRTLLPVDVLSEEWTAEVTIYSPQQIIKLYVGSHWYATTLQTLMKYPELLSNTQRVYWIAYGQTLLIHGDGQ  444

Query 444  MFRHILNFLRLGKLFLPSEFKEWPLFCQEVEEYHIPSLSEALAQCEAYKSWTQEKESENEEAFSIRRLHVVTEG  517
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 445  MFRHILNFLRLGKLFLPSEFKEWPLFCQEVEEYHIPALSEALAQCEAYKSWTQEKESENEEAFPIRKLHVVTEG  518

Query 518  PGSLVEFSRDTKETTAYMPVDFEDCSDRTPWNKAKGNLVRSNQMDEAEQYTRPIQVSLCRNAKRAGNPSTYSHC  591
           .|...|||||.|||||.|||||..||||||||||||||.||.||.|||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 519  TGPMAEFSRDAKETTACMPVDFQECSDRTPWNKAKGNLTRSSQMEEAEQYTRTIQVSLCRNAKRGGNPSTYSHC  592

Query 592  RGLCTNPGHWGSHPESPPKKKCTTINLTQKSETKDPPATPMQKLISLVREWDMVNCKQWEFQPLTATRSSPLEE  665
           .|||.||.|||.|.||||||||||||||||...||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||..||
Sbjct 593  SGLCANPRHWGGHSESPPKKKCTTINLTQKPDAKDPPVTPMQKLISLVREWDMVNCKQWEFQPLPASRSSSVEE  666

Query 666  ATLQLPLGSEAASQPSTSAAWKAHSTASEKDPGPQAGAGAGAKDKGPEPTFKPYLPPKRAGTLKDWSKQRTKER  739
           |.|..|.|||||.||.|||||||||..||||.|||.|.|||.||||||||||||.|.|||.|||||.|||.|.|
Sbjct 667  ASLHVPSGSEAAPQPGTSAAWKAHSITSEKDAGPQTGPGAGVKDKGPEPTFKPYFPTKRAITLKDWGKQRPKDR  740

Query 740  ESPAPEQPLPEASEVDSLGVILKVTHPPVVGSDGFCMFFEDSIIYTTEMDNLRHTTPTASPQPQEVTFLSFSLS  813
           ||||||||||.|...|..|.||||.||||||.||.||||||||||||.|||..||..|||||..||||||||||
Sbjct 741  ESPAPEQPLPNANGTDNPGAILKVAHPPVVGNDGSCMFFEDSIIYTTQMDNIKHTSLTASPQLREVTFLSFSLS  814

Query 814  WEEMFYAQKCHCFLADIIMDSIRQKDPKAITAKVVSLANRLWTLHISPKQFVVDLLAITGFKDDRHTQERLYSW  887
           |||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815  WEEMFYAQKCHRFLTDIILDSIRQKDPKAITAKVVSLAYRLWTLNISPKQFVVDLLAIAGFKDDRHTQERLYSW  888

Query 888  VELTLPFARKYGRCMDLLIQRGLSRSVSYSILGKYLQED  926
           ||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct 889  VELTLPFARKYGRCVDLLIQRGLSRSVSYSVLGKYLHEG  927