Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04982
• Subject: NM_177791.3
• Aligned Length: 950
• Identities: 823
• Gaps: 24

Alignment

Query   1  MEESGMAHESAEDLFHFNVGGWHFSVPRSKLSQFPDSLLWKEASALTSSESQRLFIDRDGSTFRHVHYYLYTSK  74
           |||.|..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MEEPGGLHESAEDLFHFNVGGWHFSVPRSKLAQFPDSLLWKEASALTSSENQRLFIDRDGSTFRHVHYYLYTSK  74

Query  75  LSFSSCAELNLLYEQALGLQLMPLLQTLDNLKEGKHHLRVRPADLPVAERASLNYWRTWKCISKPSEFPIKSPA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  75  LSFSSCAELNLLYEQALGLQLMPLLQTLDNLKEGRHHLRVRPADIPVAERASLNYWRTWKCISKPSDFPIKSPA  148

Query 149  FTGLHDKAPLGLMDTPLLDTEEEVHYCFLPLDLVAKYPSLVTEDNLLWLAETVALIECECSEFRFIVNFLRSQK  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 149  FTGLHDKAPLGLMDTPLLDTEEEVHYCFLPLDLVAKYPSLVTEDNLLWLAETVALIECECSEFRFIVNFLRSHK  222

Query 223  ILLPDNFSNIDVLEAEVEILEIPALTEAVRWYRMNM-----------------------GGCSPTTCSPLSPGK  273
           |||||||||||||||||||||||.||||||.|||||                       ||||.|.|.||||||
Sbjct 223  ILLPDNFSNIDVLEAEVEILEIPELTEAVRLYRMNMALQPALPGPKGSQLSLEQEEPSLGGCSRTSCPPLSPGK  296

Query 274  GARTASLESVKPLYTMALGLLVKYPDSALGQLRIESTLDGSRLYITGNGVLFQHVKNWLGTCRLPLTETISEVY  347
           |.||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGRTASVESVKPLYLMALGLLVKYPDSALGQLRIESTLDGSRLYITGNGALFQHVRNWLGTCRLPLTETISEVY  370

Query 348  ELCAFLDKRDITYEPIKVALKTHLEPRTLAPMDVLN-EWTAEITVYSPQQIIKVYVGSHWYATTLQTLLKYPEL  420
           |||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||. |||||.|.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 371  ELCAFLDKRDITYEPMKVALKTHLEPRTLLPVDVLSEEWTAEVTIYSPQQIIKLYVGSHWYATTLQTLMKYPEL  444

Query 421  LSNPQRVYWITYGQTLLIHGDGQMFRHILNFLRLGKLFLPSEFKEWPLFCQEVEEYHIPSLSEALAQCEAYKSW  494
           |||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445  LSNTQRVYWIAYGQTLLIHGDGQMFRHILNFLRLGKLFLPSEFKEWPLFCQEVEEYHIPALSEALAQCEAYKSW  518

Query 495  TQEKESENEEAFSIRRLHVVTEGPGSLVEFSRDTKETTAYMPVDFEDCSDRTPWNKAKGNLVRSNQMDEAEQYT  568
           ||||||||||||.||.|||||||.|...|||||.|||||.|||||..||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 519  TQEKESENEEAFPIRKLHVVTEGTGPMAEFSRDAKETTACMPVDFQECSDRTPWNKAKGNLTRSSQMEEAEQYT  592

Query 569  RPIQVSLCRNAKRAGNPSTYSHCRGLCTNPGHWGSHPESPPKKKCTTINLTQKSETKDPPATPMQKLISLVREW  642
           |.|||||||||||.|||||||||.|||.||.|||.|.||||||||||||||||...||||.|||||||||||||
Sbjct 593  RTIQVSLCRNAKRGGNPSTYSHCSGLCANPRHWGGHSESPPKKKCTTINLTQKPDAKDPPVTPMQKLISLVREW  666

Query 643  DMVNCKQWEFQPLTATRSSPLEEATLQLPLGSEAASQPSTSAAWKAHSTASEKDPGPQAGAGAGAKDKGPEPTF  716
           |||||||||||||.|.|||..|||.|..|.|||||.||.|||||||||..||||.|||.|.|||.|||||||||
Sbjct 667  DMVNCKQWEFQPLPASRSSSVEEASLHVPSGSEAAPQPGTSAAWKAHSITSEKDAGPQTGPGAGVKDKGPEPTF  740

Query 717  KPYLPPKRAGTLKDWSKQRTKERESPAPEQPLPEASEVDSLGVILKVTHPPVVGSDGFCMFFEDSIIYTTEMDN  790
           |||.|.|||.|||||.|||.|.|||||||||||.|...|..|.||||.||||||.||.||||||||||||.|||
Sbjct 741  KPYFPTKRAITLKDWGKQRPKDRESPAPEQPLPNANGTDNPGAILKVAHPPVVGNDGSCMFFEDSIIYTTQMDN  814

Query 791  LRHTTPTASPQPQEVTFLSFSLSWEEMFYAQKCHCFLADIIMDSIRQKDPKAITAKVVSLANRLWTLHISPKQF  864
           ..||..|||||..|||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 815  IKHTSLTASPQLREVTFLSFSLSWEEMFYAQKCHRFLTDIILDSIRQKDPKAITAKVVSLAYRLWTLNISPKQF  888

Query 865  VVDLLAITGFKDDRHTQERLYSWVELTLPFARKYGRCMDLLIQRGLSRSVSYSILGKYLQED  926
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct 889  VVDLLAIAGFKDDRHTQERLYSWVELTLPFARKYGRCVDLLIQRGLSRSVSYSVLGKYLHEG  950