Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05051
• Subject: XM_005246353.4
• Aligned Length: 1530
• Identities: 1386
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA  74

Query   75  CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT  148

Query  149  CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG  222

Query  223  GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  223  GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTG--------------------------------------  258

Query  297  CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC  370
                                                                                      
Sbjct  259  --------------------------------------------------------------------------  258

Query  371  ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG  444
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  --------------------------------GGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG  300

Query  445  GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT  374

Query  519  CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG  448

Query  593  TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA  522

Query  667  GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA  596

Query  741  AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG  670

Query  815  GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC  744

Query  889  TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT  818

Query  963  CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT  892

Query 1037  TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG  966

Query 1111  GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG  1040

Query 1185  TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG  1114

Query 1259  GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC  1188

Query 1333  ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGGTGGATCTATGACATCACGCAAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGGTGGATCTATGACATCACGCAAAA  1262

Query 1407  ATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  ATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCA  1336

Query 1481  TTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  TTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT  1386