Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05051
• Subject: XM_006496551.3
• Aligned Length: 1556
• Identities: 1275
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAG-------ACAAAAAGACACTGA  67
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||||| .|.||.||||       |.||.|||||.||||
Sbjct    1  ATGTATACGAGTCATGAAGATATCGGGTATGACCTTGAAGA-CGACCGAAAGGCTAAGAATAAGAAGACGCTGA  73

Query   68  AGCCCCACCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATC  141
            |||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct   74  AGCCCCACCCAGATATCGATGGCGGGTGGGCCTGGATGATGGTCCTCTCGTCCTTCTTTGTTCACATCCTCATC  147

Query  142  ATGGGCTCCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGAC  215
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  148  ATGGGCTCACAGATGGCCCTAGGAGTCCTCAACGTGGAGTGGCTTGAAGAGTTTCACCAGAGCCGCGGCCTGAC  221

Query  216  CGCCTGGGTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCT  289
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  CGCCTGGGTCAGCTCCCTGAGCATGGGCATCACCTTGATCGTGGGACCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCT  295

Query  290  GTGGGTGCCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCA  363
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  296  GCGGGTGCCGCCAGACAGCAATCATTGGAGGCCTGGTGAACTCCCTCGGCTGGGTGTTGAGCGCCTATGCAGCC  369

Query  364  AACGTGCATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGT  437
            ||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  370  AATGTGCAGTCTCTCTTTATTACCTTTGGAGTGGCAGCAGGCCTTGGCAGTGGGATGGCTTACCTACCTGCAGT  443

Query  438  GGTCATGGTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCG  511
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  444  GGTCATGGTGGGAAGGTACTTTCAGAAGAGACGAGCCCTGGCCCAGGGCCTCAGTACCACGGGGACAGGATTTG  517

Query  512  GTACGTTCCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAA  585
            |.||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.||||||
Sbjct  518  GGACGTTCCTGATGACCGTGTTGCTGAAATACCTGTGCGCAGAATATGGCTGGCGGAATGCTATGTTCATCCAA  591

Query  586  GGTGCCGTTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTG----GTAAAAACCCAA  655
            |||||..|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|    ||.|.|    ||
Sbjct  592  GGTGCTCTGTCCCTGAACCTGTGTGTCTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCCGAGAAGTTAGA----AA  661

Query  656  ACGACCCAGGAGAGAAAGA----TGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGT--------CA  717
            ||..|||||.||.|.||||    |||||    .||.|||||..|||||||.||||||||.||||        |.
Sbjct  662  ACTGCCCAGAAGCGGAAGAGCCGTGTGC----TCTCCCAGCTTACTCCACTGAATCTGTTAAGTCTGGAGGACC  731

Query  718  ACTGGACAGCAGG---GAAGAACAGAAGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCA  788
            |||||   |||.|   |||||||||.|.||||        |||.||||||.|||||||...|.||.|||||.||
Sbjct  732  ACTGG---GCATGGCTGAAGAACAGGACAGAA--------GGCCCGGGAATGAGGAGATGGTGTGTGACCTTCA  794

Query  789  AGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCGGGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCT  862
            |.|.||||||||.|..|.|||..||...|..||||||||..||||||||.|||||.||||||||||.||.|||.
Sbjct  795  AACACAGGAGTGTCAAGGTCAAACCCATCCGAGGAAGAATGTGTGTGCCTTCCGGGTTCTGAAGACAGTGAGCC  868

Query  863  GGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGCTTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACA  936
            .||||||..||..||||.|||.||||||...|||||||.|.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct  869  AGCTCACTGTGCAAGTCCGGAGGGGCTTTAGGGACTGGCACTCAGGCTATTTTGGGACGGCTTCACTCTTCACC  942

Query  937  AATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTTCTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCT  1010
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  943  AACCGCATGTTTGTAGCCTTTATTTTCTGGGCTCTGTTCGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCTTTCATCCACCT  1016

Query 1011  CCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACTTATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAG  1084
            .||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||.|||...|||||||||||.||.||||||||||||.
Sbjct 1017  GCCCGAAATCGTCAGTTTGTATAACTTGTCAGAGCAAAATGACACATTCCCTCTGACCTCGATTATAGCAATAC  1090

Query 1085  TTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTGGGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTG  1158
            ||||||||||.||.||.||||||.||||.|.|.|.||||||.|.||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1091  TTCACATCTTCGGGAAGGTGATCTTGGGGGCCGTGGCCGACCTCCCCTGTATCAGCGTCTGGAATGTCTTCCTC  1164

Query 1159  TTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAGTATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCAT  1232
            .|.||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||||..||||||||||.|||||..|.|||||.|||||
Sbjct 1165  ATCGCTAACTTCACCCTCGTCCTCAGCATCTTCCTTCTGCCTCTGATGCACACCTACGCGAGTCTGGCTGTCAT  1238

Query 1233  CTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTGGTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTG  1306
            .|||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||.|||||||||.||
Sbjct 1239  TTGTGCCCTAATTGGGTTTTCTAGCGGGTATTTCTCCCTCATGCCTGTGGTGACAGAGGACCTGGTTGGCACTG  1312

Query 1307  AACACCTGGCCAATGCCTACGGCATCATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCA  1380
            |.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1313  AGCACTTGGCCAATGCCTACGGCATCATCATCTGCGCCAATGGCATCTCAGCCTTACTAGGACCACCATTCGCA  1386

Query 1381  GGGTGGATCTATGACATCACGCAAAAATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAAT  1454
            ||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 1387  GGATGGATCTTTGACATCACCCAAAAATATGACTTTTCCTTTTATATATGTGGTTTGCTTTACATGGTAGGGAT  1460

Query 1455  ACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCATTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATG  1528
            |||||||||.||.|||||.|||||.||||..||.|||||.|||||||||||.||.|.|||.||.||||||||||
Sbjct 1461  ACTCTTTTTGCTCATTCAACCGTGTATTCAGATGATAGATCAATCCAGAAGGAAGTGCATAGAGGGTGCACATG  1534

Query 1529  TT  1530
            ||
Sbjct 1535  TT  1536