Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05111
Subject:
XM_006720409.4
Aligned Length:
1198
Identities:
997
Gaps:
191

Alignment

Query    1  ATGACCACCCTCTCTCCTGAAAACAGCCTCTCTGCCAGACAGTCAGCCTCCTTCATCCTGGTGAAGAGAAAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCACCCTCTCTCCTGAAAACAGCCTCTCTGCCAGACAGTCAGCCTCCTTCATCCTGGTGAAGAGAAAACC  74

Query   75  ACCCATTGACAAGACAGAATGGGACAGCTTCTTTGATGAGAGTGGCCACTTGGCCAAATCACGGGACTTCATTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCCATTGACAAGACAGAATGGGACAGCTTCTTTGATGAGAGTGGCCACTTGGCCAAATCACGGGACTTCATTT  148

Query  149  GTGTTAACATCCTGGAAAGGGGTCTGCACCCCTTCGTGAGGACTGAAGCCTGGAAATTCCTCACGGGCTACTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGTTAACATCCTGGAAAGGGGTCTGCACCCCTTCGTGAGGACTGAAGCCTGGAAATTCCTCACGGGCTACTTC  222

Query  223  TCATGGCAGAGTTCCCAGGATGAGCGGCTCACGGTGGACAGCATGAGGAGGAAGAACTACAAGGCCTTATGCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATGGCAGAGTTCCCAGGATGAGCGGCTCACGGTGGACAGCATGAGGAGGAAGAACTACAAGGCCTTATGCCA  296

Query  297  AATGTATGAGAAGATTCAGCCCCTTCTGGAAAACCTGCACCGGAACTTCACAGAGACTCGCAATAACATTGCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGTATGAGAAGATTCAGCCCCTTCTGGAAAACCTGCACCGGAACTTCACAGAGACTCGCAATAACATTGCAC  370

Query  371  GTGACATTCAGAAAATCTATGACAAAGATCCCCTGGGCAACGTCCTCATCGACAAGAAGAGGCTAGAGAAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGACATTCAGAAAATCTATGACAAAGATCCCCTGGGCAACGTCCTCATCGACAAGAAGAGGCTAGAGAAGATC  444

Query  445  TTGCTCCTGAGTTACGTCTGCAACACGCAGGCAGAGTACCAGCAGGGCTTCCATGAGATGATGATGCTCTTCCA  518
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTCCTGAGTTACGTCTGCAACACGCAGGCAGAGTACCAGCAGGGCTTCCATGAGATGATGATGCTCTTCCA  518

Query  519  GCTGATGGTGGAGCACGACCACGAGACCTTCTGGCTTTTCCAGTTCTTCCTGCAGAAAACGGAACACAGCTGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGATGGTGGAGCACGACCACGAGACCTTCTGGCTTTTCCAGTTCTTCCTGCAGAAAACGGAACACAGCTGTG  592

Query  593  TCATCAACATTGGCGTGGCCAAGAACCTAGACATGCTCAGCACCCTGATCACCTTCCTGGACCCCGTGTTTGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATCAACATTGGCGTGGCCAAGAACCTAGACATGCTCAGCACCCTGATCACCTTCCTGGACCCCGTGTTTGCT  666

Query  667  GAGCACCTAAAAGGGAAGGGTGCAGGGGCTGTGCAGTCCCTCTTCCCCTGGTTCTGCTTCTGCTTCCAGCGTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCACCTAAAAGGGAAGGGTGCAGGGGCTGTGCAGTCCCTCTTCCCCTGGTTCTGCTTCTGCTTCCAGCGTGC  740

Query  741  CTTCAAGTCCTTCGATGATGTCTGGAGGCTCTGGGAGGTTCTGCTGACGGGGAAGCCCTGCAGGAACTTCCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCAAGTCCTTCGATGATGTCTGGAGGCTCTGGGAGGTTCTGCTGACGGGGAAGCCCTGCAGGAACTTCCAGG  814

Query  815  TGCTGGTGGCCTACAGCATGCTGCAGATGGTGCGGGAGCAGGTGCTGCAGGAAAGCATGGGCGGGGATGACATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTGGTGGCCTACAGCATGCTGCAGATGGTGCGGGAGCAGGTGCTGCAGGAAAGCATGGGCGGGGATGACATC  888

Query  889  CTCCTGGCCTGCAACAACCTCATCGACCTTGATGCTGATGAGCTGATCTCTGCCGCCTGCGTGGTTTATGCTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCTGGCCTGCAACAACCTCATCGACCTTGATGCTGATGAGCTGATCTCTGCCGCCTGCGTGGTTTATGCTGA  962

Query  963  GCTCATCCAGAAGGAT----------GTTC-CTCAGACATTAAAG----------------GATTTCTTCCTC-  1008
            ||||||||||||||||          ||.| .||| ||.|.|.||                |.|.|||.||.| 
Sbjct  963  GCTCATCCAGAAGGATCCCATGGCAGGTGCATTCA-ACTTCAGAGACACAGACTGTGCCACGTTCTCTACCACT  1035

Query 1009  --------------------------------------------------------------------------  1008
                                                                                      
Sbjct 1036  GACCCATGCATGTTGCTCCTCATGGTCTTCTCGTTGTTTGCACATGTAGCTCCTTCCTCCCTGAGCAGGCTGTA  1109

Query 1009  --------------------------------------------------------------------------  1008
                                                                                      
Sbjct 1110  CTACTTGAGAGCAGGGCCCTCATCCCCCATTCCCTGTGTCCATCCCAGTGGGTCTGGGCACCCAGAGGCTCAGG  1183

Query 1009  --------------  1008
                          
Sbjct 1184  AGAATGTCGCTGCT  1197