Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05195
- Subject:
- NM_001174151.1
- Aligned Length:
- 1284
- Identities:
- 975
- Gaps:
- 309
Alignment
Query 1 ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGAATACCCTGAAGATGTAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------ATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC 61
Query 371 CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT 135
Query 445 CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA 209
Query 519 GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA 283
Query 593 ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA 357
Query 667 GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC 431
Query 741 TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG 505
Query 815 AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG 579
Query 889 CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA 653
Query 963 GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA 727
Query 1037 AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG 801
Query 1111 AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA 875
Query 1185 GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA 949
Query 1259 ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA 1284
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA 975