Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05195
- Subject:
- XM_011512533.2
- Aligned Length:
- 1339
- Identities:
- 1193
- Gaps:
- 146
Alignment
Query 1 ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGA------------------- 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------ATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGTCCATGGAAAAATTGTCT 57
Query 130 ------------------------------------GAATACCCTGAAGATGTAGCTCCTACTGTTGGATTTTC 167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCTGCAAAACTGGTCCCTGGTGCTGCTGATCTAAAGGAATACCCTGAAGATGTAGCTCCTACTGTTGGATTTTC 131
Query 168 AAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGTGGAATAAGAATTCGGGGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 AAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGTGGAATAAGAATTCGGGGAA 205
Query 242 TCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAGTGATGAAGAGAGAATGGAA 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 TCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAGTGATGAAGAGAGAATGGAA 279
Query 316 GAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGCCTATATTGGTGTTGGCAAA 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGCCTATATTGGTGTTGGCAAA 353
Query 390 TAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCTCTGGAAAAATTGGTCAATG 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 TAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCTCTGGAAAAATTGGTCAATG 427
Query 464 AGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAAGAAAATTGACAAGTCCATT 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 AGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAAGAAAATTGACAAGTCCATT 501
Query 538 AAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAAATGAACGCATCCAAAAAGA 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 AAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAAATGAACGCATCCAAAAAGA 575
Query 612 GACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGAGTGCGAAAATTACGAGAAG 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 GACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGAGTGCGAAAATTACGAGAAG 649
Query 686 AAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGCTGAGTTGGACCCAGAACCA 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 AAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGCTGAGTTGGACCCAGAACCA 723
Query 760 ACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTGAAAGAGAGAAAAAAAACCA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 ACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTGAAAGAGAGAAAAAAAACCA 797
Query 834 AAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAGCAAATAGAGACACAAGGCC 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 AAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAGCAAATAGAGACACAAGGCC 871
Query 908 AGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAAGGAGGCATTAACACAGCAG 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 AGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAAGGAGGCATTAACACAGCAG 945
Query 982 TTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAAAGAAAACTAAGAAACTAAG 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 TTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAAAGAAAACTAAGAAACTAAG 1019
Query 1056 AATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAGAGTCCAACGCCACCCCCAC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 AATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAGAGTCCAACGCCACCCCCAC 1093
Query 1130 CCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGAGCCTCTTGGTGAAACACAT 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 CCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGAGCCTCTTGGTGAAACACAT 1167
Query 1204 CATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTAACAGTGATGCTCATGATGT 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 CATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTAACAGTGATGCTCATGATGT 1241
Query 1278 GATCTCA 1284
|||||||
Sbjct 1242 GATCTCA 1248